作者Fourfish (~四条鱼~)
看板Biotech
标题[问题] 想请教关於Inclusion body纯化的问题
时间Thu Jan 4 01:07:29 2007
唔...我的实验现在卡在蛋白质的expression和纯化已经有一段时间了...
我先说明一下现在实验的状况跟目的好了....
希望有前辈能指点我过程是否有问题
我的实验是要将表现某蛋白质的基因transformation到E.coli
利用E.coli表现蛋白质 并纯化此蛋白质作为疫苗使用
蛋白质大小约48kD
表现载体为Promega的pGEMEX 利用T7 polymerase进行表现
E.coli strain 是BL21(DE3)...如果学长没说错的话...
Induce 3hr後 收菌液离心 接着PBS重新悬浮後 用超音波破菌 离心 收上清液和沈淀
跑SDS-PAGE後 确定了我的蛋白质在沈淀中(inclusion body)
基本上到这里应该没甚麽问题...
因为我的蛋白质是单纯要打老鼠用的
暂不在乎蛋白质的folding正确与否 另外我希望能纯化出多量且较纯的蛋白质
所以我想直接纯化inclusion body来得到我的蛋白质
我在网路上收集一些纯化inclusion body的方法(都找到wash的方法..)
最後我用wash的方法作纯化 buffer成份为:
buffer1:0.5% Triton X100; 50mM Tris-HCl pH8; 100mM NaCl; 0.1% sodium azide
buffer2:成份一样 仅不含triton X100
步骤为:以buffer1再悬浮清洗pellet,离心18000Xg,20min,4度C 重复四次
再以buffer2洗过以去除triton X100,离心後保存pellet
原步骤最後会用8M Urea去溶pellet
可是当我这样作 之後SDS-PAGE跑出来结果非常的丑...而且根本不能判断结果...
所以我只用PBS冲起pellet就拿去跑SDS-PAGE (有99度煮过)
现在问题来咧....
SDS-PAGE的结果 我要的蛋白质的确还在 且明显的除掉了其他的proteins
但是...gel上却有两条bands 大小相近...我以7.5%的gel要跑到最底才分的明显...
估计应该46kD左右吧...
另外浓度都还蛮相近的(从染色上看来...)
我想了解另一条蛋白质是甚麽、会不会影响实验 才知能否利用这些纯化出来的蛋白质...
所以...一条是我的...另外一条约46kD左右...会是甚麽呢?@@
会是E.coli的蛋白质吗?
还是我的蛋白质folding的问题??不过跑SDS-PAGE煮过应该不至於吧...??
另外我考虑到的是vector的关系吗?
还是整个纯化步骤少了些甚麽...?
希望有经验或了解inclusion body纯化的人能指点我><"
或者可以提供其他纯化的potocol让我参考(wash或surcose gredient超高速离心法都可)
希望可以帮帮我!!如需要补充其他流程或状况的 我会在补充
在此先感谢了!!
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 61.64.93.103
1F:推 chiehgriffin:可以用TOF看看是那一个蛋白质 01/04 10:58
2F:→ chiehgriffin:做疫苗?那您应该是NHRI的人噜? 01/04 11:00
3F:推 chiehgriffin:可以试试低温表现,可能对soluble form有帮助 01/04 11:03
4F:推 HXZ:比较non-induciton和induction的SDSPAGE可以知道那两条band 01/04 12:25
5F:→ HXZ:是不是其实都是你induce出来的...是的话就放心去打ab吧 01/04 12:26
6F:推 HXZ:刚刚仔细看一下你的描述 我想很有可能是sample denature不完全 01/04 12:30