作者werthers6925 (...)
看板Biotech
标题Re: [问题] 有关cloning的问题
时间Wed Jan 10 12:57:18 2007
※ 引述《anchi (请给我胖老鼠~~~)》之铭言:
: 我想要clone 人类chromosome上的某个基因,
: 之後要接到retroviral的vector上,
: 请问,有办法直接用设计两端primer方式,夹出这个基因吗?
: (之前做细菌某基因的clone会用这个方法,不晓得是否可用在人类chromosome上?)
: 还是,要用取出RNA做RT PCR 方式做出cDNA,再去接vector?
: 另外,假设预计要用的vector是pSIR,
: 若我想把上面的promoter换成另一个,要怎麽换?
: 可以直接用restriction enzyme切下原本promoter区域,
: 然後ligase欲换的promoter上去吗?
: 这样,是不是还要确认nucleotide base数目是否有shift?
: 第一次做这方面,请问大家,
: 我这样的实验设计对不对,有没有错误需要修改或需要注意的事项?
: 谢谢~
你可以直接设计两端primer去夹
但是设计完的的primer请你上NCBI去做Blast
以及去UCSU去做预测, 看是否真的只会夹到你要的gene
NCBI blast:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
UCSU PCR:
http://www.genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr
如果都没问题...你应该可以直接用genomic DNA直接做
不过...请你考虑你要的target gene
在genome上是否有intron的存在...如果有intron...
建议你还是从cDNA开始钓吧
另一各问题, 关於promoter.....
如果我没记错....promoter应该是没有nucleotide base shift的情形...
所以...你如果想简单做...用酵素切一切接一接应该就可以了...
但是请注意...不是所有的promoter都适合拿来用
有些promoter需要enhancer或是其他element才能作用....
你要考虑进去.......
不同的promoter距离start site的远近也不一样
基本上...一般常用的promoter都是经过测试过的
如果你要换promoter....你不仿参考这各promoter他们是怎麽设计的
你再考虑是否要这样做吧......
愿顺利
BEST
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