作者FromWood (木由)
看板Biotech
标题Re: [求救] 我的western blotting一直做不好。
时间Sat Jan 13 21:33:35 2007
※ 引述《inspire0311 (每一天都值得庆祝)》之铭言:
: 我已经做western blotting一个月了,
: 结果一直出现这样的杂线?
: 我问了学长,结果说我没有用TBS洗乾净,
: 我自觉已经洗得很乾净了。
: 为何还是这样?请帮我看一下。
: 谢谢。
: 照片在这里:
: http://www.wretch.cc/album/show.php?i=inspire0311&b=4&f=1902925055&p=0
首先请问你做的流程?
是曾经做过正常的western blotting
或一直都长这个样子?
我看了你的图
感觉是SDS PAGE 本身就没有跑好
你的蛋白很明显没有够清晰的分开。
虽然你的marker是有分开的,
但marker中的蛋白本来就单纯,
他有分开不代表PAGE本身的分离度是好的;
包括样品处理是不是ok,以及胶本身是不是ok
1.检查一下sample处理的过程中有没有问题。
加热时间够不够,温度有没有到,
sample buffer要不要重配等。
我觉得你应该拿一些其他的来跑看看
随便收点细胞lysate来,看actin就可以了。
同时可以一起跑一点BSA(10-100ng即可),
当做单一蛋白在你的样品处理方式下的参考。
首先要确认你整个实验方法是OK的,
再来看看是不是sample本身的问题。
2.PAGE本身凝结的不好,甚至Acrylamide生成就不是平均的网状架构
所以跑的都会歪歪的,
也有些蛋白会顺着做不好的地方一路残留,
产生你所谓纵向的线。
可以检查一下配方,同样的配方别人跑OK吗?
同样的配胶溶液人家跑OK吗?
凝胶时间是不是过长或过短?
APS是否新鲜?
Tris的ph值是否正确?
做一片好胶是很重要的。
3.跑电泳的时候是否温度过高?
电流值会不会过大?有没有可能因为过热而degrade?
(不过感觉不太像)
4.你的sample中有什麽东西浓度很高吗?
在约40 kDa的地方有很明显的蛋白痕迹
而底下又有蓝色的呈色
不知那个位置是你的样品大小的地方吗
或其实可能是因为我上面说的40 kDa蛋白过多造成的non-specific binding
可能要判读一下讯号的真伪
因为我都是压片,没有做过直接膜上呈色,
这部分讯号的判读可能要请高手帮忙解答^^
5.抗体本身是不是一只够好的抗体?
在你图中各处都有细小的点,
我认为那都是抗体的non-specific binding。
这跟你在做一抗的hybridize条件,
二抗的hybridize条件,
还有你wash的程度都有关系。
每只抗体的能力也不同,所以有可能要去测试找出最佳的用法。
包括titer、包括反应温度、包括时间;
有的抗体就是非四度 overnight不行,
有的抗体就是需要较高的tween 20来洗。
另,你是用TBS来洗 还是TBST洗?
既然叫做洗,就要有清洁剂喔。(不好笑,逃~)
加油罗! 其实满多地方可以抓抓看有没有问题的
祝你实验顺利:D
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