作者keiny (lav dolce vita(分生所))
看板Biotech
标题Re: [问题] 请问有人做过 in vitro trascription & …
时间Thu Jan 18 23:52:44 2007
※ 引述《newivan (.......................)》之铭言:
: ※ 引述《keiny (lav dolce vita(分生所))》之铭言:
: : Q1: 有大大做过这个实验吗?
: : 我想请教其中的细节
: : Q2: 还是有其他更适合的方法
: : (看unmodified form proetin 之 expression 情形)
: : {前情概要}
: : 小弟正在做这个实验(In vitro transcription & translation)中
: : http://www.promega.com/pnotes/60/6079_07/promega.html
: : 目的: 要看在很少modification的环境下
: : 我的protein的表现情形
: : (注) 我是用S35-Met label 的
: : 我要表现的DNA (约1800bp) construct在pet15b的vector中
: : 因为它有T7 promoter
: : 手边又刚好有
: : http://www.genomex.com/vector_maps/pet15bm.pdf
: : {惨状}
: : 不过我照着protocol做了几次 压了几次片子
: : 都没有看到我想看的protein !!
: : 只有一些background band(compare with control:没有放入任何DNA的Reaction !!)
: : 恳请诸君给予建议
: : 感激不尽~~~~
: Q1: 我之前用过 Promega TNT Quick coupled transcription/Translation systems
: 做过(不知你用哪个,不过原理应该差不多 ),也是透过T7 promoter, 用35S-Met
: labeled,效果还不错. 没有得到你要的 protein 其实要 debug 的地方还蛮多的.
: 以上叙 Kit 为例:
yes...我也是用同一套kit
: a. 如前人所提的, Kit 是否有问题, 应该先用 Kit 附的 control plasmid 做看看.
ok!! 我会在repeat看看
: b. Kit 是否保存於 -70 度, 因为 Kit 中附的 master mix 对 CO2 sensitive,
: 所以不要用乾冰保存.
恩!
: c. Kit 中附的 master mix 是否有重覆解冻过, 建议不要重覆解冻, 用不完就丢了.
恩!
: d. 你的 DNA 中要有 start codon 及 stop codon.
有! 我有送过定序!!
: e. DNA template 的量是否适当, 建议 1 ug (0.2~2 ug 也可),太多太少都不好.
我也是这个量
: f. 避免 RNase contamination, 应以操作 RNA 的方式进行 (RNase-free).
: g. Master mix 用手温快速解冻, 再置於冰上使用.
这个我再改进一点!!
: h. 反应的温度是否保持在 30 度, 太高太低都会影响反应.
yes! 我在恒温箱中操作
: i. 可提高 Mg2+ or K+ 浓度, 增加反应的效率,如加 1~3 ul Kit 所附的 T7 PCR
: enhancer.
可是我是用plasmid DNA 应该可以不加这个吧?
: j. 避免 Reaction 中有 Ca2+, 因 Ca2+ 会活化一些 nuclease, 造成 DNA template
: or mRNA degradation.
: k. DNA template 中若有 EtOH 残留会抑制 translation.
: Q2: 其实这方法是 In vitro 的, 对於你要看 unmodified protein expression
: 的实验目的似乎不太恰当,protein expression 受很多因素影响, 表现多表
: 现少都是 artificial 的 (而且你用的是 T7 promoter,而非原 gene 上的
: promoter), 另外,我猜你指的 modification 应该是 post-transcription
: modification 吧, 若是 post-translation modification 应该跟此 protein
: 的 expression 较没有关系吧. 至於其他的实验方法我就不清楚了, 不过
: 我也很想知道, 希望有其他专家来教教我们.
YES!!我指的是PTM!!
以上谢谢~~~
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