作者bee (Bee)
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标题Re: [问题] fusion protein的纯化
时间Fri Feb 16 02:37:34 2007
※ 引述《yffurdyeknom (Unhurried Justice)》之铭言:
: 如题
: 请问板上有做过带有6 his-tag fusion protein纯化的大大
: 在从column上elute蛋白的时候
: 是用多少imidazole浓度的elute buffer去elute的?
: 小弟用175 mM imidazole的elute buffer去elute
: 但似乎没有elute出来
: 而查纯化的书
: 上面写在某些case中
: 要用250 mMimidazole浓度的elute buffer去elute
: 因此想问问大家是否有用如此高浓度imidazole浓度的elute buffer去elute的经验
175mM 如果洗不出来
有几种可能
第一个他的结合力太强......这种可能性不大但不是没有
His-tag 有一个特色其实你用到100 mM imidazole 就会开始有些蛋白开始洗出ꠊ只是量很少
第二个
我曾经用到 500 mM imidazole 没有问题
第三
你的蛋白根本没有结合到管柱上面去
可能是过柱的条件不对或是你的蛋白根本就没出来
过柱的时候把每一个fraction 都收一点
一起跑胶确认你要的东西跑到哪里去
: 如上述所题
: 小弟这次的纯化没有成功
: 因此也考虑fusion protein存在於inclusion body中的可能性
: 在lysate(BL 21)离心(11000rpm 30min 4度c)之後
: 观察到存於离心管管壁上的pellet非常难用水洗掉
: 加普通的detergent也洗了半天才洗掉
: 而以之前纯化E.coli(DH 5 alpha) plasmid的经验(同样都是100ml culture)
: 在lysate离心(11000rpm 30min 4度c)之後管壁上的pellet不会难洗
: 因此在此才推论fusion protein存於inclusion body中的可能性
: p.s. 在此之前我有先进行一次1ml culture的test实验
: 结果我要的fusion protein的确是存在於supernatant之中
: 在此也顺便请问一下板上高手们
: 什麽情况下会形成inclusion body?
: 我在一本纯化的书中看到culture size会影响
: 所以我推测这是fusion prtein从原本test显示的supernatant中跑到inclusion body原因
: 不知这样是否正确?
这是一种可能
其实这一点很容易确定
每次做大量培养诱导蛋白产生时
除了大瓶收下来以外
你也可以同时收个小量
先做确认
当然会多花一点时间跟功夫
但是至少不会做到後来甚麽蛋都没有
就算失败也至少可以知道问题出在哪里
: 而我也想请问大家这样会形成inclusion body的原理是什麽?
: 还有也请问大家
这太复杂
自己看一下书
: 离菌或离lysate时的温度会有造成inclusion body形成吗(我都用4度c)?
没听说过
也不太可能
inclusion body 主要是培养条件造成的
做成lysate 时菌体已经打破
他想形成恐怕还没机会
: 又如果把经IPTG induce之後的菌液冰到4度c三个小时後再处理(lyse)
: 也会造成inclusion body形成吗?: 问了一堆问题
同样的答案
如上
主要是因为培养条件
冷冻会让细菌的生长减到很慢
: 希望有经验的前辈们给我一些指示~~~
: 谢谢
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