作者cayumi (far away)
看板Biotech
标题Re: [求救] cloning
时间Tue Feb 27 18:43:17 2007
※ 引述《Adler (Adler)》之铭言:
: ※ 引述《cayumi (far away)》之铭言:
: : Promega的enzyme我没用过 我只用过TAKARA 和Bio-lab(NEB)的enzyme
: : Promega的的T4 ligase 他本身附的是10X buffer
: : 他们公司另外有出一种 2X rapid ligation buffer,我是都用这个 ligation buffer
: : 我ligation的方法是 insert: 8μl
: : vector : 3μl
: : 2X buffer:12μl
: : ligase: 1μl
: : 置於16度c水浴槽(or 4度C)作用至少16个小时以上
: : 以heat-shock的方法做transformation
: : 我们家是用GeneMark的elution kit 个人认为满好用的
: : 我plasmid都是用一般传统的mini-preparation抽的
: : 可以踹看看用3%的gel(注意3%很容易就凝固了) 跑100V 40分钟
: : 所以你vector有做CIP处理噜!? CIP处理时间太久会影响到你ligation喔
: : 抗生素没用错吧 有看过很天兵的朋友用错抗生素 == ==+
: : 这个我觉得有点怪怪的 应该只会出现single band吧,不应该有连续的band吧
: : 可是照理说用Kit抽应该不会有RNA的干扰才对,可以放张电泳图吗!?
: : 还有elution完後有load 1μl(怕太淡可以load 5μl)下去跑电泳check吗!?
: : 不久前我们lab的学妹要把100bp左右的片段接到7 kb的vecor上
: : 我是敎她insert和vector都分别用NEB的enzyme做double digestion
: : 用100V跑3%gel 40分钟,elution
: : ligation的条件就如上述所说的 做个两次就出来了
: : 你在踹看看吧
: : 另外问一下,你用的切位是TA-vector本身的切位,还是你自己在primer上设计的切位!?
: 我是用我自己在primer设计的切位
那如果是这样的话
你可以用含你的insert的plasmid(应该有定序过,确认序列无误吧!?)当作 DNA template
用"好一点"的taq(ex:takara 的ex-taq)做pcr
primer就用你有设计切位的primer,总体积的话30-60μl皆可
pcr跑完之後,pcr product直接用1% gel去跑电泳,跑完之後做elute
elute完之後的product,下个10 or 20 μl去做digestion,之後再elute
虽说pcr可能会有base出错的机会,但是若你taq用好一点,或是你用有pfu的taq
56bp应该是不太有机会出错的
: ㄜ...我之前说的连续的band,是指它是一整片,由一百分布至其下皆有
那就很怪啦
电泳图应该是长成这样子吧
marker
--- ----- vector
100bp ---
----- insert
一整片我觉会不会是RNase没处理完全而残留的RNA呀
你plasmid抽完之後load个1-5μ去跑电泳
如果100bp附近有亮成一片的话 那个应该都是RNA啦
: 可能造成你的误会了... 抱歉..@@
: 切RE的gel我没有照像耶...抱歉
: 我会用你的方法再试试的~^^ 谢谢你~
: ps.抱歉这麽晚才回...@@
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心一但开始动了,与沉静便划不上等号........
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