作者liuse (充实自己,提昇自己)
看板Biotech
标题Re: [问题] total protein extraction问题
时间Wed Mar 14 23:42:26 2007
※ 引述《kayle (kay)》之铭言:
: 关於mammalian cell total protein extraction的问题
: 因为lab设备问题,无法用物理方式破细胞
: 我在网路上找了几个buffer
: 目前用的是类似RIPA的配方
: 含Tris, NaCl,EDTA, 0.2% Triton, 0.1% SDS, 1mM PMSF
: 10的6次方细胞加入50ul
: 再把细胞lysis後,12000rpm,离心 30 min之後
: 有个取上清液的步骤
: 我可以很清楚的看到细胞被lysis, solution成透明
: 可是整个solution呈现很黏稠的的情况(DNA造成的吗?)
: 几乎没办法取"上清"
这个配方的lyse算是很暴力的
破膜破核,许多membrane-associated protein都会release出来
我有做过类似的实验,为了extract顽强的membrane-associated protein
黏稠後100度去煮个十分钟(小心不要让水蒸乾)
溶液会不黏稠
之後dilute total solution volumn让solution中SDS浓度降低
这样之後sample可以IP,或做其他的用途
我这样做是OK
但是一般用buffer破细胞应该不需要加SDS吧
我自己的实验经验一般用NaCl配上Tx-100和其他八拉八拉的inhibitor
就很好用了
: 除了增加reagent用量外
: 该怎麽处理这个情况??
: 请有经验的大大帮忙一下,感谢!!
: 另外一个笨问题
: SDS是很强的介面活性剂吧
: 那他到底会不会把protein denature掉??
会喔,整个把native protein翻出来
: 那如果後续要做蛋白质纯化 (protein要有function)
: 是不是就不应该用SDS??
的确不能
: 那又该用什麽reagent来lysis细胞呢???
就用一般的吧
我的lyse buffer(whole cell extract buffer)是
NaCl 150mM or 200mM
Tx-100 0.2%
Tris-HCl(pH 7.5) 20mM
EDTA&EGTA 1mM
和protease inhibitor,DTT,若是要研究phosphorylation还
要加phosphatase inhibitor
: 感谢!!!
希望对你有帮助
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