作者leondemon (狗狗)
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标题Re: [求救] 实验的一些设计
时间Sat Nov 3 00:51:06 2007
发表浅见 :)
实验是为了证实某个假设(或理论) 因此必须设计「实验组」
为了证实某个假设(或理论)「正确无误」 因此必须设计「对照组」
为了证实某个实验过程和结果「正确无误」 因此必须设计「控制组」
所以理想的实验设计 除了「实验组」、「对照组」之外 必须作「控制组」
实验组:基於某个理论或是假说,在现有的技术上测试的组别。
对照组:证实实验组现象,是由某一个「操控变因」引起,而做的比对组别。
理想上,好的对照组,和实验组只能有一个(或一种)变因的差别。
通常对照组会将该变因设计为「无变因」或「背景值」。
控制组:为了证实整个实验过程中没有发生错误,而做可预期结果的组别。
即为确认「操控变因」以外的因素(控制变因)没有错误。
理想上,好的控制组,除了判断实验过程没有错误外,
还能帮助找出实验失败的原因。
※ 引述《linzhengzhan (研究所:硕士班vs博士班)》之铭言:
作个补充
控制组 是将某个实验「测试项目」置换成「可预期结果的项目」
来确保实验结果不是false positive(伪阳性)或false negative(伪阴性)
以下positive称为(+) negative称为(-) control称为ctrl
(因为要确定「控制变因」没有问题 因此称为「控制组」)
: 简单的说:
: positive control:就是一定有的东西,如果实验结果没有出来,就可能是实验有问题…
正控制是将测试项目置换成「确定会做出结果的项目」
因为预期会「有」因此称为「正」
若(+)ctrl结果呈现(-),表示控制变因有问题,
通常是reagents少加,或是变质。
此时若test项目也呈现(-),则可能为false(-)
(因为可能是reagents发生问题才导致negative)
此时若test项目呈现(+),那就要检查日期是否为农历七月(好吧~很难笑)。
而找出问题的方式为:
1.先将(+)ctrl重跑一次(勿将上次的mixture拿来重复使用),
如果可以的话在再找另外一个「确定有结果的测试项目」来同时测试。
此为测试是否因为「少添加」某reagent(s)而导致上次ctrl的失败。
2.若依然呈现(-),则将所有reagents(控制变因)换成新的(或另一来源),
重新再跑一次(+)ctrl,能的话测试两个以上「确定应有结果的测试项目」。
此为主要测试「确定应有结果的测试项目」没有发生问题。
3.另将reagents的一项(或一组)逐一更换新的,来找出有问题的reagent(s)。
如果实验经费充裕,可以不做此步骤而将可能有问题的reagents全部丢弃。
4.以上1~3项可三者同时或挑两项同时测试(自行拿捏时间和实验经费的平衡点)。
若依然1~3项都是(-),则必须检查protocol或instrument是否有问题。
: negative control:就是一定不会有的东西,如果结果有,就“自求多福“……
负控制是将测试项目置换成「确定不会有结果的项目」
因为预期会「没有」因此称为「负」
若(-)ctrl结果呈现(+),表示控制变因有问题,
通常是reagents受到污染。
此时若test项目也呈现(+),则可能为false(+),若为定量则会造成数据的不正确。
(因为可能是reagents发生问题才导致positive)
此时若test项目呈现(-),那有很有可能「确定不会有结果的测试项目」受到污染。
而找出问题的方式为:
1.先将(-)ctrl重跑一次(勿将上次的mixture拿来使用),
再多找另外一个「确定不会有结果的测试项目」的来源做同时测试。
此为测试或是操作过程是否造成污染(技术问题,甚至换人操作),
同时也测试「确定不会有结果的测试项目」是否为污染源。
2.更换新的一组耗材(会接触reagents的项目)或操作环境。
确定不是耗材或环境本身引起的污染。
3.另将reagents的一项(或一组)逐一更换新的,来找出有污染的reagent(s)。
如果实验经费充裕,可以不做此步骤而将可能有问题的reagents全部丢弃。
4.以上1~3项可三者同时或挑两项同时测试(自行拿捏时间和实验经费的平衡点)。
若依然1~3项的结果都是(+),则要认真思考污染来源为何。
: internal control:控制实验的条件,已减少变因;在结果方面,是大家长的一个样;
: ex. western blotting 常用就是β-actin,以确定每个well的
: protein量都一样……
: RT-PCR常用的就是GAPDH之类的……
internal ctrl跟实验结果的(+)/(-)无关(定性部份) 而是跟「定量」有关。
也就是「相对定量」所做的normalization ,
确保test项目的数据的相对大小(即倍率)为正确。
通常挑选为internal ctrl的项目,应该要为稳定(变异性小)、均匀、不易受影响。
例如某测试项目的结果 A为B的两倍,
但是internal ctrl的结果 A亦为B的两倍,
那麽经过normalization後(将测试数据除以internal ctrl数据),
A与B并无差异。
通常定性实验都会做(+)ctrl和(-)ctrl
而定量实验都会做internal ctrl和(-)ctrl(因为(-)ctrl呈现(+),那定量就有问题)
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有错请指教罗~
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.129.62.151
1F:→ leondemon:补充一下:另外还要呈现「再现性」而必须做「重复试验」 11/03 00:52
2F:→ leondemon:定性兼定量则三种ctrl都做,但不一定有适当的ctrl可做。 11/03 01:00
3F:→ leondemon:另仪器所做的blank,意义上比较接近internal ctrl。 11/03 01:05
※ 编辑: leondemon 来自: 140.129.62.151 (11/03 01:55)
4F:推 pshamrock:那麽基本的观念 结果大家竟然那麽认真回答 大家真是好人 11/03 09:18
5F:推 bluecsky:其实多看别人呈现的data都会有这些吧XD 11/03 10:22
6F:推 hughzero:谢谢各位 真的是感激不尽 QQ 11/03 18:07