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标 题Re: [求救] 有没有人会使用image j分析gel DNA的浓度?
发信站清华生命科学 BBS (Wed Nov 14 02:42:05 2007)
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※ 引述《[email protected] (e04)》之铭言:
> 如题
> 因为抽出来的DNA不纯
> 用OD值去测的结果非常不理想
> 跑胶後因为有smear的情形
> 所以也无法直接和marker比较
> 听说image j这个软体可以做这个分析
> 但是下载之後我却不会用
> 做到三条lane plot之後就卡住了
> 有没有人可以告诉我详细的分析方法
> (e.g 按a键--按b键...)
> 谢谢
个人主观上认为 smear 太严重神也救不了你
另外用影像定量在准确性上本有一定的限制
个人的做法是 先要跑一张用各种已知浓度的 DNA 跑的 gel
照下来转灰阶(通常 8bit, 256 阶就够了)
放 imageJ 里面作 calibrate(calibrate 详细做法请查线上说明)
然後开你要测量的档案
先 subtract background
(同样,详细做法查线上,不过我担心 smear 很严重的时候 background 会去不掉)
然後框起你要测的 gel 上面你认为可能是 signal 的部分
measure 他的 integrated density(记得在 set measurements 里面勾选先)
如果你 calibrate 有作对的话
会出现一个新视窗里面就有测出的量了
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