Biotech 板


LINE

嗯 谢谢那位大大推那麽多文 我了解那公式了 我说的y=mx+b这个 x轴是DNA量 Y轴是CT值 当斜率M = -3.2左右(刚查到 可是不知为什麽 = =) 会有最佳效率 现在我还是不知为什麽会有这值=  = 请会大大的教我一下 谢谢 ※ 引述《Phaeton (凰呀的鸣叫~)》之铭言: : 请问一下喔 : 因为想了解Q PCR : 所以爬文找知识 : 看到这篇里面提到的重要公式 : 我在知识+和GOOGLE都找不太到 : 可以请哪位大大解释一下 : Y是什麽?? : 而N应该等於多少?? : CT值吗?? : 另外我可以用斜率的方式来看EFFICIENCY吗?? : 就是用 Y = MX + B的方式来看  : M应该要等於多少才会有最好的效率?? : 谢谢 : ※ 引述《rpr (Cathy)》之铭言: : : PCR有一个重要的公式 : : y=(1+e)^n e是PCR反应的效率,而n次方指的就是cycle number : : 就我所知real-time PCR,是希望每一个PCR反应能尽量达到 e=100% : : 所以才会限制产物大小 (<250 bp) 跟反应温度(2-step PCR) : : 当然对於template的要求也是非常的高 : : 如果你的template quality不佳,做出来的结果常常会认你吐血 : : (我在做基因定量,range只有1-4 copies,但是Ct差个1结果就差两倍,真的会吐血 : : 观察国外这方面做的好的实验室,对於template的quality要求是严格到不行) : : 如果你都按照他的限制下去做,基本上他们是可以保证一定可以得到很好的结果 : : 但是温度是绝对可以调整的 : : 如果你的基因在3-step PCR做的2-step PCR还好,当然没有理由不调整温度 : : (这又牵涉到primer的设计,所以他们也出了一套软体专门帮你设计适合的primer) : : 只是你要确定这样条件下的e比他们条件下的e来的好 : : 另外,反应体积也是要尽量精确,因为reagent里还有ROX dye, : : 机器会在判读时拿这个萤光作为不同well之间体积的校正 : : (但是怎麽校正我就不清楚了,有兴趣者可以自行测试,再来跟大家分享吗?) : : 不过一我的经验,差个1-2 micro-liter是影响不了多少啦!(我做25 micro-liter的) : : RT Real-time我也做过,用的是TRIzol抽的 : : OD 260/280实在不怎麽好(说来惭愧,1.6我就欢天喜地了) : : 但是也都做的出来 : : 刚开始还傻傻的买他的one-step RT-PCR reagent(贵到爆) : : 後来也开是自己转(我用过BD以及invitrogen的kit) : : 但是结果仍然满意,所以抽RNA跟RT的kit应该是影响不大 : : 反而是你操作的好不好的问题 : : 另外你的反应做大於40 cycle,然後Ct只会在40以後出现 : : 我也如bloodgas大大会建议你看一下internal control的Ct会在多少出现? : : 可以一并确认是quality的问题 或者你的基因表现就是低到不行 : : 希望对你有所帮助 --



※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 61.228.177.81







like.gif 您可能会有兴趣的文章
icon.png[问题/行为] 猫晚上进房间会不会有憋尿问题
icon.pngRe: [闲聊] 选了错误的女孩成为魔法少女 XDDDDDDDDDD
icon.png[正妹] 瑞典 一张
icon.png[心得] EMS高领长版毛衣.墨小楼MC1002
icon.png[分享] 丹龙隔热纸GE55+33+22
icon.png[问题] 清洗洗衣机
icon.png[寻物] 窗台下的空间
icon.png[闲聊] 双极の女神1 木魔爵
icon.png[售车] 新竹 1997 march 1297cc 白色 四门
icon.png[讨论] 能从照片感受到摄影者心情吗
icon.png[狂贺] 贺贺贺贺 贺!岛村卯月!总选举NO.1
icon.png[难过] 羡慕白皮肤的女生
icon.png阅读文章
icon.png[黑特]
icon.png[问题] SBK S1安装於安全帽位置
icon.png[分享] 旧woo100绝版开箱!!
icon.pngRe: [无言] 关於小包卫生纸
icon.png[开箱] E5-2683V3 RX480Strix 快睿C1 简单测试
icon.png[心得] 苍の海贼龙 地狱 执行者16PT
icon.png[售车] 1999年Virage iO 1.8EXi
icon.png[心得] 挑战33 LV10 狮子座pt solo
icon.png[闲聊] 手把手教你不被桶之新手主购教学
icon.png[分享] Civic Type R 量产版官方照无预警流出
icon.png[售车] Golf 4 2.0 银色 自排
icon.png[出售] Graco提篮汽座(有底座)2000元诚可议
icon.png[问题] 请问补牙材质掉了还能再补吗?(台中半年内
icon.png[问题] 44th 单曲 生写竟然都给重复的啊啊!
icon.png[心得] 华南红卡/icash 核卡
icon.png[问题] 拔牙矫正这样正常吗
icon.png[赠送] 老莫高业 初业 102年版
icon.png[情报] 三大行动支付 本季掀战火
icon.png[宝宝] 博客来Amos水蜡笔5/1特价五折
icon.pngRe: [心得] 新鲜人一些面试分享
icon.png[心得] 苍の海贼龙 地狱 麒麟25PT
icon.pngRe: [闲聊] (君の名は。雷慎入) 君名二创漫画翻译
icon.pngRe: [闲聊] OGN中场影片:失踪人口局 (英文字幕)
icon.png[问题] 台湾大哥大4G讯号差
icon.png[出售] [全国]全新千寻侘草LED灯, 水草

请输入看板名称,例如:WOW站内搜寻

TOP