作者meiosisLin (吽爸)
看板Biotech
标题Re: [求救] 接好的plasmid切不出小片段来
时间Fri Nov 30 23:55:45 2007
给你另一种测试的方式
举例:先准备两种菌种
一个是你Ligase inasrt之後的菌...
一个是直接transformation 空plasmid的菌
在有insert的disc中取20个clone
没有insert的dice挑一颗 clone(就是plasmid only的菌) 做NC
养个3ml o/n
这20+1个菌液各取个50μl 以等体积加入phenyl/Chloroform extraction
mix 离心个十分钟 (直接把菌打破,让DNA plasmid 都悬浮出来)
再取上层液直接跑个小於1%的胶
如果有insert的话,理论上跟空plasmid来比
会出现较高的Band........(就是空palsmid 和有insert的差异)
再从有上飘的哪几个clone挑出来切enzyme......
跟PCR的方式来screen 没有好坏之差,只是方法不同罢了
给你个建议,请慢用
※ 引述《bluecsky (我要蓝蓝淡淡的天空)》之铭言:
: ※ 引述《foureyes ()》之铭言:
: : 从九月开始就在作构筑质体的动作
: : 老师要我用 PCR 夹出 insert 片段
: : clone 到 pET32c 上面後 transform 到大肠杆菌里面去做表现
: : 我 transform 完後在 LA plate 上有长出菌落
: : 我以为这样就表示有接到? 因为之前曾经长不出菌落过
: : 然後挑菌落转养後抽质体确认
: : 用与 digest 时相同的酵素 HindIII & NdeI 来切
: : 37度C 反应 2小时15分钟
: : 跑电泳却没有看到理论上一大一小的片段
: : (我的小片段应该是 500 bp 左右)
: : 已经重复五六次了都没有看到小片段
: : 请问这表示我根本从头到尾都没接到吗?
: : 我看有人说用两种酵素的话要分一前一後处理
: : 我是两种酵素一起加下去
: : 会是这个原因所以切不出来吗?
: : 还是有其他的问题?
: : 先谢谢大家了(跪)
: 阿..都重覆了5 6次了..
: 而且你digest的时间都这麽长了
: 不应该有切不出来的现象(除非你enzyme加真的很少很少..应该不可能吧)
: 就相信他吧..乖乖去重新ligation一批吧..
: 有长不一定是你有接好转进去
: 很多时候都是false positive..
: 假如你之前的都没长colony的话
: 建议你从抽vecoter跟PCR insert这边重新开始
: 把整个实验都重新setup一下
: 做construct就是这样..反正一直做不出来就从头开始再弄一次
: 有时候就会出来了
: 我一般enzyme digest是用来做二重确认才做的
: 第一步都是用PCR screening
: 直接用牙签点一下colony然後再点一下到PCR的管子中
: 加入适当的primer跟buffer dNTP Taq..就开始做了
: (primer我会选insert的forward primer跟vector上的reverse primer)
: 一次可以快速的screeningㄧ堆
: 再把screen出现positive结果的在点去养broth
: 之後才用enzyme digest做第二次确认
: 大多两种enzyem各1 ul..用於total体积20 ul
: 切一小时
: 就很够了
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夜生活不只是一种生活,更是一种态度,音乐有很多类型,夜店有很多种类
喜欢与否只是一种偏好,却不代表全部的选择,夜生活的多样与多变应该是
让人有更多更广的眼光看生活与体验.........
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◆ From: 123.192.165.194
1F:推 bluecsky:这方法是快速粗萃取plasmid..不过还是要一个o/n.. 12/01 12:24
2F:→ bluecsky:个人认为最快的还是用PCR..可惜的是false positive也多 12/01 12:25
3F:→ bluecsky:不过这方法取出来的都很...杂..看个人习惯使用吧 12/01 12:25
4F:推 meiosisLin:两种方式我都用过,方法看喜好~clon做的出来才是重点 12/01 17:21
5F:推 bluecsky:同意~~做的出来才是重点.. 12/01 17:46