作者greenmoon00 (苍天之月)
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标题Re: [求救] cloning 救郎喔~~
时间Thu Dec 13 17:56:34 2007
※ 引述《wensing (潜力股)》之铭言:
: ※ 引述《bluehttp (虾毁)》之铭言:
: : 最近在做cloning,
: : 做到快发疯了.
: : 我用 XhoI 及 Hind III (biolabs),
: : 去切 insert 和 vector,
: : 跑电泳也确定有切动,
: : 之後用T4 DNA ligase 进行 ligation, 然後overnight,
: : 隔天再transform (DH5a),recovery 1hr,涂plate, overnight.
: : 可是隔天来看没有长.....
: : 我有试过用 fermentas 的 ligase 及 biolabs 的 ligase,
: : 可是一样都没长,
: : 不知道尚有哪些细节我没注意到,
: : 希望有经验的大大可以帮助我阿!
: 1. 切的时候 是一起混切? 还是先後切?
: 2. 切完後 再经胶体纯化後,DNA sample 是否还在?
: 3. ligation时,大小片段混合後,加入buffer前是否先45℃加热再冰浴?
: 全程是否冰浴操作?有没有再额外加入1mM ATP? 大小片段混合比例是否正确?
: (po 一下 你的步骤)
XhoI跟HindIII是可以合切的 用2号的样子 虽然我是比较喜欢先後切
切完後胶回收 然後胶回收的产物回溶後取等量下去跑一片胶
再依band的亮度决定ligation的vector:insert
我习惯是...
vector跟insert的亮度去除以长度得到莫耳比 vector:insert 最好是1:3~5
例如
V : I
亮度 1 : 1
----------------------------
长度 5 : 1
这时候代表胶回收的产物浓度vector:insert大概是1:5
所以直接取1:1体积的vector跟insert下去ligation
ligation时先将二次水 vector insert加热45℃ 5分钟 於冰上待凉後
加入ligase跟buffer 这里要注意buffer ligase buffer会有ATP在里面
通常存於-20时会有白色沉淀 使用时务必要把白色沉淀溶解 (用震的)
(我记得这是ATP的沉淀...好像有点怪...)
之所以会有额外加ATP也是这个考量...怕没溶或degrade...
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.120.208.5
1F:推 ermine:白色沉淀是DTT吗? 12/13 20:46
2F:推 gis968:是DTT为还原剂 12/13 22:16
3F:推 csmceddie:请问一下vector insert加热45℃ 5分钟的目的是什麽阿 12/14 01:39
那时候翻Molecular clone是说37℃ 5~10分钟 详细原因我倒是不知道
後来实验室的protocal就被改成45℃ 也没有原因....@@...
※ 编辑: greenmoon00 来自: 140.120.208.3 (12/14 14:00)
4F:推 oyjn:我'听到的是vector会自动卷成环状, 45度会帮助打开使insert 12/19 18:50
5F:→ oyjn:进入 12/19 18:51
6F:推 bhchun:加热都打开 减少接错的机会 01/03 23:55