作者sGoat (无三小羚羊)
看板Biotech
标题Re: 切胶回收做PCR
时间Fri Jan 4 11:51:34 2008
※ 引述《reteporeh (台风也喜欢放假)》之铭言:
: 想请问板上的各位
: 有将PCR产物做胶回收然後再进行PCR吗?
: 目前遇到的情形是
: 胶回收完的产物再进行相同条件PCR时
: 在跑胶确认时,没有看到任何的band
: 重复做过几次,情形依然
: 想请问在做完胶回收後
: 再进行PCR时
: 有什麽条件特别要求的吗?
: PS..胶回收是使用Kit做的
sorry...
我的意思是为什麽要在PCR完之後跑胶回收"再跑一次PCR"...
(胶体回收也要看的到产物在哪里吧?纯粹猜测位置再切胶回收要是没产物不就做白工?)
假使你的primer设计得够专一的话...
单纯考虑扩增量不够...
将你的PCR产物稀释50倍之後再以同一组primer进行PCR扩增...
(甚至是使用更专一的Nest primer扩增)
就能将你第一次没被放大到可见程度的产物再放大一次...
一直持续到你所要的产物被放大到你要的量...
假设是扩增要进行ligation的片段...
那你的RE切位一定设计在primer上...
(此句修正,要外加切位才是在primer上)
在没有产物的情形下,为何不先考虑PCR是否成功?
再假设你进行了PCR扩增ligation的片段...
你得到了产物,你将产物以RE切过了
跑了胶回收完,你想要确认回收到的是不是你要的片段...
因此以相同的primer又跑了PCR想说要是同样的东西应该有东西会P出来...
可是你的template上primer相对应的黏接位置已经被你用RE切掉了...
那你怎麽能够预期PCR能够P出东西来呢?
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 210.69.150.30
1F:推 rangelovero:最後两句不太对喔~不会因为RE切过就放不出来 01/05 12:29
2F:→ rangelovero:primer上目标片段与外接切位比例约2:1 or 3:1 01/05 12:32
3F:→ rangelovero:扣除切位的base专一性就已足够P出东西了 01/05 12:34
4F:→ sGoat:感谢指正,所以我想原PO应该要仔细叙述一下实验流程... 01/05 14:24
5F:→ sGoat:因为影响的点太多了... 01/05 14:28
※ 编辑: sGoat 来自: 61.221.60.215 (01/05 14:30)