作者hosaile (我和你:))
看板Biotech
标题[讨论] 如果要做一个基因被调控的机制
时间Fri Jan 4 20:33:01 2008
假设目前我知道 A 基因在某个 cell line当中会被某个 compound 强烈活化
但是加入了一个kinase inhibitor之後会被抑制到几乎到跟control一样低
目前所知的条件有
1. A gene的promoter sequence (不确定是不是全部的promoter 从NCBI上有发表过
的paper中搜寻到的)
2. 知道两个确定的transcription factor binding sites, 和两个目前尚未确定的sites
你会怎样开始研究这个基因被调控的机制呢?
目前这个基因被研究主要都是在应用方面, 就是它的function有哪些, 但是本身被
调控的机制却是几乎不了解。
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我不是要写期末报告
而是我目前做的实验遇到一个瓶颈 不知道要怎麽继续下去 而且没有paper可以参考
而我目前的发现是一个transcription factor (B)的确会结合到promoter上
而在加入kinase inhibitor後 in vivo下有稍微抑制其binding (几乎没差)
in vitro则是看不到差异
就目前的data来看 尚未有直接证明 B 调控 A gene 的证据
是希望可以往上面所提到的 B transcription factor对这个基因的调节的重要性走
目前是有一些想法 也跟老师谈过了 但是希望听听不同的意见
麻烦各位版友了!
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◆ From: 140.112.122.26
1F:推 buterscotch:Northern analysis of the mRNA level of the gene?? 01/04 21:13
2F:→ hosaile:楼上是否可以更清楚的解释?是说在做怎样的处理之後做 01/04 22:52
3F:→ hosaile:Northern blot? 01/04 22:53
4F:推 cutebetty:RNAi抑制B的表现 然後用repoter gene看A基因的表现?? 01/05 01:05