作者kiwicc ()
看板Biotech
标题[请益] 如果Primer的GC contant太高会怎麽样吗?
时间Wed Jan 9 10:03:22 2008
如题,最近要设计一对Primer~基本上Forward的地方没有什麽问题,
但是要设计reverse的那个片段GC contant非常高,若以20 bp里面GC就占了70%以上。
请问如果Primer的GC contant高出70%以上会造成什麽不良影响吗???
还是说顶多就是黏合温度设定高一点而已? 谢谢
PS.我要增幅的片断预计是450~475 bp
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幸福 应该是建立在彼此的信任 而不是金钱的依赖
是让彼此做对方的第二双手 而不是要对方当只听话的狗
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.120.196.232
1F:推 sinwam:PCR时会容易打不开,可能会做不出来或是不漂亮!! 01/09 10:21
2F:推 silverberry:加 DMSO 可以让二级结构比较容易被解开~~ 01/09 11:02
3F:→ silverberry:之前有做过 GC 占 85% 左右的~~ 还蛮 ok 的^^ 01/09 11:03
4F:推 sGoat:通常会要求primer pair之间GC值不要差太大,GC高就要一起高 01/09 11:30
5F:→ sGoat:不过还是做得出来,但是与其去try条件,不如在一开始就设计好. 01/09 11:33
6F:推 sGoat:另外要是你用DNAMAN设计的话,primer数值不是worth都可以P出 01/09 12:36
7F:→ sGoat:打错...是primer select,不是DNAMAN =.= 01/09 12:38