作者aggaci (小提琴是种很难的乐器)
看板Biotech
标题Re: [讨论] EMSA几个想不通的问题
时间Wed Feb 13 00:01:12 2008
※ 引述《shonshonGie ($75)》之铭言:
: (先说我操作的NF-kB的EMSA实验,使用的是panomics的kit)
: 加入cold probe与hot probe竞争後,
: 为何原有的band消失的话,就是specific binding呢?
"可能"是specific binding
也就是说这段序列可能有你预测的TF consensus binding site
我会说可能是因为此shift被竞争掉也许是因为cold probe其他的序列所造成
而不是你预期的那个consensus binding site
: 如果这是non-specific binding,加入cold probe不是也有band消失的可能吗?
可能 当你加到1000-10K倍时可能会发生
但50-200倍不太可能有这种情形
: 还是前提是:此probe与真正binding的位置有最好的specificity,
: 所以先消失的band是真正signal
: 但是之前学姐教我时说,cold probe要尽量加到使band都消失
我想他说的是cold probe和labeled probe是同一种序列
: 这不就是人工导致的结果?
不全然是 你误解了
: 还是加入cold probe做为control另有原因??
positive control or negative control
: 我一直想不通,还被老板给问倒了>_<, 烦请板上各位指导指导罗 谢谢^_^
--
http://www.wretch.cc/blog/aggaci
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.114.100.165
※ 编辑: aggaci 来自: 140.114.100.165 (02/13 00:01)