作者AS1 (AS1)
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标题Re: [求救] real-time pcr的问题
时间Thu Feb 21 18:48:02 2008
这个问题再次重伸 首先专员来两次 第二次待一整天
结果有些还是没出来 单个SAMPLE有很多波峰
那是不是 每个PRIMER都有固定的波峰
跑胶结果 有些没东西 或者是其他杂BAND
说我们环境太杂 但问题是跑RT-PCR就不会有这种状况
之後电话联络 建议我们换抽RNA的KIT
之前是用传统方式抽的(TRIZOL)
结果还是没有预期产物
有什麽理由是买机器的公司要负责试
如果她们完完整整跑出来一次 DATE都很漂亮
我会来这 照做就好了 做不出来是自己的问题
※ 引述《leftt (left)》之铭言:
: 原PO的问题应该是不懂realtimePCR
: 而且是整个公司都不太懂
: 然後ROCHE的专员跟版众一样 秀才遇到兵 呵呵
: 如果搞不懂 换AB, BioRad的realtime机器也是一样
: 八连排的tube 出来的data也不会比较漂亮唷
: 而且AB的试剂也没有便宜到哪里去吧
: 几个重点
: 1.realtimePCR本来就可以做诊断
: 就我所知疾管局就有用 当年诊断SARS时也很风光
: 你可以带队杀去学的地方其实还不少
: 问题是 一般人都只愿意带学习态度诚恳的人做实验吧
我们不需要那麽风光 当首例
这个我要问一下 SARS当初如果用RT-PCR做的出来吗
: 2.RT-PCR跑胶有band所以你认为诊断正确 不需要sequence就可以
: 但是你怎麽知道你哪个band是正确的放大标的物?
: 也许是数个尺寸一样但是内容不同的放大产物混合在一起勒
: realtimePCR可以利用melting curve侦测是否为单一纯产物
这个我不懂 因为 既然melting curve可以判断是否为纯产物
那如果melting curve 就是一样的产物吗
: 3.毛细管的产物也可以抽出来跑电泳
: 如果你们实验设计是正确的 那这个电泳产物和RT-PCR的产物应该是要一致的
: 普通PCR的primer也可以试跑realtimePCR的
: 有时候你可以发现原来先前跑普通PCR的primer是大大的有问题
: 可能是产物不对 也可能有严重的primer dimer
DIMER的问题已经解决了
现在同一SAMPLE
再试第三组PRIMER
: 4.过了melting curve後整个萤光值掉下来
: 请先了解melting curve的定义以及用途
: 还有萤光染剂发光的原理及时机
: 5.分子生物学实验本来就要求较纯的原料
: 因为在放大检测的状况 一点细微的误差很容易就被无限放大而盖住原有资料
: 普通 PCR也无法忍受乱七八糟的检体吧 只是他出错的时候比较不容易被发现
: 相对而言 data也比较不可信赖
: 如果目标真的不好侦测 也许不要用SyBr 换TaqMan probe看看
: 正确率也许高一点
要花钱 这个我不提
: 6.realtimePCR的确为快速诊断的工具
: 如果你了解早期诊断的工具就知道 有些病毒培养确认动辄是两周三周的时间
: 跑realtimePCR可以缩短到数小时即有结果
: 而ROCHE毛细管PCR由於是空气加热 升降温快速 cycle time较一般机器短
: 说快速也没错
早期诊断 通常有症状才会要我们去
所以用RT-PCR都做的出来
初非是很奇怪的SAMPLE
所以有培养设备 但不养
: 你们的问题是出在对实验原理不了解
: 其实只要找一个学分生的 有在作realtimePCR的
: 花个几天时间大概就可以找出毛病在哪里
: 对於会用的人
来两次了 还是没解决问题
倒是建议我们换抽RNA的KIT
: LightCycler其实挺好用的 介面也比较亲切
: 可是对於不懂也不愿意去学的人
: 那只是一台一百多万的小电锅而已 而且还会狂吃耗材钱唷
: ※ 引述《micocat (de novo)》之铭言:
: : RT-PCR 跟real-time pcr的要求是不一样的
: : 我们实验室有遇过同样的primer RT做的出来,real-time却p不到的情形
: : 後来换了primer就解决了
: : 建议可以换组primer试试
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 122.123.116.192
※ 编辑: AS1 来自: 122.123.116.192 (02/21 18:56)
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※ 编辑: AS1 来自: 122.123.116.192 (02/21 19:12)
1F:推 chvkimo:不好意思 小小的提醒 资料=DATA 不是 DATE 02/21 21:03
2F:推 a64toto:不用再po这类的文章了啦,反正别人说什麽您都不理 02/21 21:11
3F:推 rebirth:该停+1 一直鬼打墙 02/21 23:59
4F:推 Proteomics:该停+1 一直鬼打墙 02/22 00:12
5F:推 CErline:人家只是卖机器,没有在包生小孩的,机器没问题就没事了 02/22 10:44
6F:推 forWinds:???...我记得TRIZOL应该已经不算传统方法了吧 02/22 15:22
7F:→ forWinds:因为老板常被师母念不用传统方法而是用TRIZOL抽 传统的好 02/22 15:23
8F:→ forWinds:要用更多的有机溶剂 老板觉得很脏 可是师母觉得那才可靠 02/22 15:24
9F:→ forWinds:我只有用过TRIZOL 已经很麻烦了 没想到还有更传统的 Orz 02/22 15:24
10F:推 bluecsky:其实trizol已经是快速法了..真的传统法更麻烦没错 02/22 16:02
11F:推 chvkimo:对阿 我记得trizol算是kit吧 02/22 16:24
12F:推 forWinds:嗯啊 老板也说过TRIZOL是kit 原来有更快的kit呀 (高兴~) 02/22 17:13
13F:→ AS1:请多读书 QIAGEN有抽RNA的KIT 02/22 18:06
14F:→ AS1:你从哪里看机器没问题 有说她们来未必做的出来 02/22 18:07
15F:推 soom:敬请诸位板友不要使用挑拨式的言词 这样无利於讨论 02/22 18:45