作者hal (结训了...)
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标题Re: [求救] 一个gene有三个很接近的isoform
时间Fri Apr 11 20:07:05 2008
※ 引述《anubis2 (寒风吹过我的心)》之铭言：
: 各位大大好
: 小的 目前在研究一个gene 它有三个很接近的isoform
: 分别为1 2650bp (mRNA 为580-2193 长度1613bp)
: 2 2073bp (mRNA 为12-1616 长度1604bp)
: 3 2060bp (mRNA 为55-1503 长度1448bp)
: 三个isoform的大小非常接近，而且做过序列比对，非常接近，只有一个部分有
: 约40bp的不同，所以无法从pcr 或 western 中分别出来
: 可是目前一定要解决就是 要知道那个isoform才是主要受到调控的部分
: 请教各位大大，要如何分辨谁是谁，谁的调控最高哩??
: 谢谢，感恩。
你的mRNA是指CDS的话
PCR 应该就可以吧
比如 1就有1000bp左右是UTR的部分应该会有不同於 2 3 的片段
至於 2 3 就找 找看有没有不同的地方应该会有150bp左右的差异
isoform如果是alternative splicing 所造成的或许就会很难分
不过以这三个大小看来应该还可以分的开
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