作者candy315 (沉淀)
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标题Re: [求救] FISH跟microarray有什麽差别
时间Tue Apr 15 11:30:18 2008
其实根据我的了解
如果说是 "microarray"
其实是看gene的 expression
也就是sample以RNA的型式为主
而送去给厂商做...厂商也会先帮你测RNA的QC
如果要看genomic DNA copy number的不同...应该叫 array -CGH
全名为Array-based comparative genomic hybridization
但J大说的没错...
如果用array-CGH去看DNA的copy number...只能看出哪一条染色体的某个片段是否有
duplication or deletion
如果是balance traslocation....就无法在array-CGH上看出差异
这时就要求助於FISH了
※ 引述《jjlee (感觉, 真的存在吗?)》之铭言:
: 若以分析 DNA 样品而言...
: 分析特性:
: FISH-> 直接看某特定DNA片段的出现位置, 还可以算多少copy
: Microarray-> 利用数十万个probes来对应genomic sequence, 分析所有DNA片段,
: 不过只能由讯号得知哪些片段有copy数变化, 但无法知道片段位置改变
: 实验特性:
: FISH-> probe 去黏 DNA
: Microarray-> fragmented gDNA 去黏 array probes
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◆ From: 203.64.80.19