作者danielsfh (大头)
看板Biotech
标题[求救] 关於microRNA microarray 和 real-time PCR 的问题
时间Fri Apr 18 01:52:18 2008
我是利用invitrogen 出的 NCode microRNA microarray
来侦测癌细胞和正常细胞内 microRNA表现的差异
再利用ABI 公司的 Taqman real-time PCR 来comfirm
可是real-time PCR的结果 和array 却是大大的不同
有的甚至是相反的或是表现没有什麽差异性
我做了八个microRNA 几乎都是这样
sample是病人的检体和老鼠
总共做了十片的array
请教一下各位
有人知道原因是什麽吗
或是可以给我什麽建议
谢谢~~~~~~
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 125.231.210.136
1F：推 freesoul:一样的sample，我会相信real-time PCR的结果 04/18 05:05
2F：→ freesoul:array出来的东西误差很大的 04/18 05:05
3F：推 soom:我们家也是遇到这个问题.. microarray跟PCR R < 0 04/18 12:18
4F：推 soom:後来我们就不管nCode了 array改用别家的 04/18 12:20
5F：推 jjlee:NCode的数据正规化是问题所在, 没有可挽救的方法 04/18 19:18
6F：→ jjlee:找oligo probe的, 会比NCode打点好很多.. 04/18 19:19
7F：推 justwhite:array因normalise条件不同 结果也会不同 qPCR较准+1 04/18 20:43
8F：→ danielsfh:谢谢大家给我的回答 那目前我最好的方法 是不是就是直接 04/18 21:24
9F：→ danielsfh:放弃array的结果了 04/18 21:25
11F：→ ccfccf:miRNA signature predicts survival and relapse in Lung C 04/19 00:29
12F：→ ccfccf:Cancer Cell. 2008 Jan;13:48-57. Yang PC 04/19 00:31
13F：推 pinpin:NCode要做normalization真的是个问题 j大能否分享一下心得 04/19 14:26
14F：→ danielsfh:我看过Yang PC先生的那篇PAPER了 听说 砸了一千多万做的 04/19 17:43