作者linker0726 (哀..烦阿)
看板Biotech
标题Re: [求救] mutant-enriched PCR 文章问题
时间Sat May 17 08:45:39 2008
※ 引述《albertwang (会思考的鱼)》之铭言:
: ※ 引述《linker0726 (哀..烦阿)》之铭言:
: : http://clincancerres.aacrjournals.org/cgi/content/full/12/1/43
: : 我看了这篇文章
: : 有一个地方很不解
: : 就是他Fig. 2跑Gel时确认时,本来WT的不是已经用限制酶切过了(配合Fig. 1)
: : 应该是会断成好几个片段(应该是两个)
: : 为什麽到这边就变原来的一段了呢~?
: : 注:WT分别是A图的138bp和B图的130bp
: : 感谢
: 首先我在对全部基因的seq时发现一件事情
: paper上的enon跟NCBI genebank不同刚好跳一下
: 在 paper 在 NCBI
: exon19 等於 EXON21
: exon21 等於 EXON23
: 这是一件粉神奇的事情
: 一开始我以为是isoform
: 但是刚刚再却确认一次(不过有可能我太累了 有高手帮指正)
: 还是一样
: 再来你的疑问
: 这不困难重点在他的primer设计
: NC_000007.这是基因的代号NCBI的
: EXON 21
: ATCCCAGAAGGTGAGAAAG(aTAA)AATTCccgtcgctatcaaggaattaagagaagcaacatctccgaaagccaaca
: aggaaatcctcgatgtgagtttctgctttgctgtgtgggggtccatggctctgaacctcagg
: EXON23
: cagccaggaacgtactggtgaaaacacCGCAGCATGTCAAGATCACAGATtttgggc(tggcca)aactgctgggtgc
: ggaagagaaagaataccatgcagaaggaggcaaagtaaggaggtggctttaggtcagcc
: AGCATTTTCCTGACACCAGGGA
: 大写部分是primer
: ()部分是限制每
: 他对限制脢改变所以pcr结果会出现图2
: 至於图1陷阱需要看实验方法才能董
: 这你就自己读一下罗
: 呵呵加油
图一有陷阱?
其实我看不懂图一最後Wild的画法 好几条虚线代表什麽?
而且跑完第一次PCR用限制酶切後
到底第二次PCR时会不会再放大 它好像也没讲到
我觉得图二应该跟图一之後无关 他只是要测它的敏感度
所以用WT下去稀释 直接下去跑PCR 然後用同样的限制酶切
这边看来 好像第一次PCR完用限制酶切 之後好像会在黏回去?
不过不知道会不会再放大?
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