作者michaelhsien (MichaelHsien)
看板Biotech
标题[闲聊] 关於生物冷光鼠的定量方法
时间Tue Jun 17 18:46:11 2014
最近实验室想要玩玩
萤光酵素的
生物冷光小鼠实验
(
luciferase,
bioluminescence mice)
经过定量、套图後,就像是
http://ppt.cc/PUUb 这种图片
(参考於Shane Massey. et al, frontiers Microbiology;
http://ppt.cc/AWIk)
於是我建立了稳定表现Luciferase的细胞
然後我发现,其实一般在拍Western blot的机台 (GE LAS-4000)
就可以拍到细胞液发光的样子
(Luc.细胞液 + substrate 混合後,load到96孔白盘中照相
其实在暗一点的地方,就可以肉眼观察到它发出微微的光)
所以我想...
用平常在拍WB的方式,最後一样存成16bit的TIF档
再利用ImageQuant等软体进行定量 (比较周围讯号强度即可)
但是,ImageQuant只能算出
在框选区域中所有的讯号
是否有软体可判读框选区中,
讯号分布的强弱?
甚至可以将定量出来的讯号强度,套成各种颜色
(就像是文中最上面老鼠那般,弱=蓝,中=黄,强=红,的讯号)
虽然很多相关文章里面都有说明,他们显像所用的机器
但是我想是否可利用现有机器,DIY出类似的效果...
当然...
我觉得可以把它分成许多小格去定量後
再依照结果将它填上不同颜色
但是这样好像很血汗阿 orz!!
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