作者Egbertkuo (Egg)
看板Biotech
标题[讨论] 关於plasmid extraction
时间Thu Nov 6 15:14:14 2014
各位板友大家好，
是这个样子的，
由於我们实验室抽plasmid方式有两种!
一种是传统的Alkaline lysis method
我们用来做contruction check使用；
另外一种就是用一般commercial kit做~
我们发现用传统法抽的浓度用Nano drop 1000测
约莫是用Kit抽浓度的十倍~
但是跑1% agarose gel时
发现好像Alkaline lysis抽出来的量虽然很高，
但量却跟实际跑胶的浓度差十倍～
假设来说已Kit抽出来为基准，
我loading 1000ng(Alkaline lysis)≒ 100ng plasmid(kit)
我们老师以前不是用nano drop 1000
所以老师觉得我们这样测出来有点点奇怪，
但我们实验室大家讨论很久还是不太知道为什麽？
Nano drop 设定上有什麽特别导致这样方式有差吗
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 120.126.61.215
※ 文章网址: http://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1415258057.A.B5E.html
1F：推 aceliang: 传统方法有用RNaseA处理嘛? 11/06 15:35
2F：推 chenmick: kit有过resin,应该比较纯,浓度则以比跑胶为准 11/06 15:41
3F：→ chenmick: 我用传统法抽plasmid,为了定序再用kit通resin,浓度也是 11/06 15:42
4F：→ chenmick: 10倍 11/06 15:43
5F：推 Ianthegood: 只能说 nanodrop不准XD 11/06 18:11
6F：推 KittyGod: 直上Qubit 11/06 21:27
7F：推 datro: nanodrop 230nM很高吗? 11/08 02:30
8F：推 tynse71864: nanodrop不准+1 建议跑胶看 11/09 21:02
9F：→ Egbertkuo: 有加RNase A，我们用kit抽出来band跟跑胶比较像，传统 11/14 18:52
10F：→ Egbertkuo: 我们也觉得很奇怪 11/14 18:53
11F：推 satasumi: nanodrop不是很准,用QUBIT 或分光光度计吧 12/03 14:01