作者licat (licat)
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标题Re: [求救] 有关PCR的问题
时间Wed Feb 11 20:51:20 2015
不好意思因为资讯太少,我想问一些问题便於判断
: : 如果是失败的会保留原长度约为1.1KB,
请问想去除的片段长度多大?
: 是对genomic DNA上的目标基因利用一段具有抗生素抗性基因做取代。
请问是甚麽抗生素基因?使用的互换机制是?
(抗生素基因是带在质体上?或着你送入的是线状DNA?)
然後你应该是使用在抗生素盘上长出来的菌落去抽DNA、做後续PCR吧?
: 是不是要再另外购买什麽或是连络厂商才能打开机器的权限?
我觉得不像是PCR或抽DNA的问题,
因为你的control反应很专一,这种PCR你沾一点菌落或菌液直接当模板都做得出来
所以你没夹出来,我觉得比较可能是
1. 那些长出来的菌落是污染的杂菌,没有你primer可认得的序列
(如果你提供详细实验流程跟结果:
像是怎麽送入DNA?涂盘後生长菌落数?会比较好判断)
2. 那些菌落都是insertion mutants,然後你primer座落的位置被互换掉了
(这得看primer座落位置跟整个互换的设计)
3. 那些菌落都是insertion mutants,primer也没错,
但PCR反应没有强到可以夹出2 KB大小,所以你可以:
(1) 将annealing降到50,没出来再降到45,再没出来就放弃
(2) 换别的厂牌的taq,直接测试50跟45度annealing
(3) 重新设计其他primer
我想你可以先测试上述的PCR条件,
希望你annealing温度一降就夹出来,问题解决~
祝实验顺利
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