Biotech 板


LINE

※ 引述《licat (licat)》之铭言: : 不好意思因为资讯太少,我想问一些问题便於判断 :  请问想去除的片段长度多大? 去除的片段长度约为450 bp, 而使用插入取代的抗性片段约为1.6 KB。 : : 是对genomic DNA上的目标基因利用一段具有抗生素抗性基因做取代。 : 请问是甚麽抗生素基因?使用的互换机制是? 利用kanamycin 15ug/ml, 互换的机制是同源重组交换的方式。 有一个大陆的网站写得满浅显易懂的, http://www.yrbio.com/service/red-et-recombination-technology 主要的参考是这篇paper http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10829079 :  (抗生素基因是带在质体上?或着你送入的是线状DNA?) : 然後你应该是使用在抗生素盘上长出来的菌落去抽DNA、做後续PCR吧? 送入的抗性基因是线状的DNA, 主要设计是在取代用的抗kanamycin基因序列前後, 各加上目标取代位置前後各50bp送入。 主要送入方式都是以电穿孔的方式。   因主要表现重组蛋白的质体为温度敏感型, 过程中都有注意培养的温度是否有低於30度。 : : 是不是要再另外购买什麽或是连络厂商才能打开机器的权限? :  我觉得不像是PCR或抽DNA的问题, :  因为你的control反应很专一,这种PCR你沾一点菌落或菌液直接当模板都做得出来 :   :  所以你没夹出来,我觉得比较可能是 :  1. 那些长出来的菌落是污染的杂菌,没有你primer可认得的序列 :    (如果你提供详细实验流程跟结果: 那个我有取只含有重组蛋白质体的菌来pcr过, 用原本的primer表现, 的确原本的片段长度约为1KB左右。 应该可以初步排除杂菌的可能性。 还未定序过,也有可能是其他的杂菌。 :    像是怎麽送入DNA?涂盘後生长菌落数?会比较好判断) 都是使用电穿孔的方式, 恩我用附图的方式可以吗? http://ppt.cc/5iBm 请原谅我必须删掉我的目标序列名称。    :  2. 那些菌落都是insertion mutants,然後你primer座落的位置被互换掉了 :    (这得看primer座落位置跟整个互换的设计) 阿~~~ 希望不要阿。 我连发票都是一整年顶多中一张200的机会啊 QAQ   :  3. 那些菌落都是insertion mutants,primer也没错, :    但PCR反应没有强到可以夹出2 KB大小,所以你可以: : (1) 将annealing降到50,没出来再降到45,再没出来就放弃 : (2) 换别的厂牌的taq,直接测试50跟45度annealing : (3) 重新设计其他primer :    其实原先主要的annealing温度为58度, 现在有尝试过, 50 55 58 60 62 64, 主要都是30秒。 也有尝试着加入DMSO, 其结果如下图: http://ppt.cc/C99u :    我想你可以先测试上述的PCR条件, :    希望你annealing温度一降就夹出来,问题解决~ : 祝实验顺利 感谢您, 我会先尝试着降低温度试试看~ --



※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 120.107.165.123
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1423705236.A.612.html
1F:→ polomi: 片段的GC值 约为57% 02/12 11:03
2F:→ Invec: kanamycin浓度拉高一点看发生同源重组的菌落会不会少一点 02/12 17:09







like.gif 您可能会有兴趣的文章
icon.png[问题/行为] 猫晚上进房间会不会有憋尿问题
icon.pngRe: [闲聊] 选了错误的女孩成为魔法少女 XDDDDDDDDDD
icon.png[正妹] 瑞典 一张
icon.png[心得] EMS高领长版毛衣.墨小楼MC1002
icon.png[分享] 丹龙隔热纸GE55+33+22
icon.png[问题] 清洗洗衣机
icon.png[寻物] 窗台下的空间
icon.png[闲聊] 双极の女神1 木魔爵
icon.png[售车] 新竹 1997 march 1297cc 白色 四门
icon.png[讨论] 能从照片感受到摄影者心情吗
icon.png[狂贺] 贺贺贺贺 贺!岛村卯月!总选举NO.1
icon.png[难过] 羡慕白皮肤的女生
icon.png阅读文章
icon.png[黑特]
icon.png[问题] SBK S1安装於安全帽位置
icon.png[分享] 旧woo100绝版开箱!!
icon.pngRe: [无言] 关於小包卫生纸
icon.png[开箱] E5-2683V3 RX480Strix 快睿C1 简单测试
icon.png[心得] 苍の海贼龙 地狱 执行者16PT
icon.png[售车] 1999年Virage iO 1.8EXi
icon.png[心得] 挑战33 LV10 狮子座pt solo
icon.png[闲聊] 手把手教你不被桶之新手主购教学
icon.png[分享] Civic Type R 量产版官方照无预警流出
icon.png[售车] Golf 4 2.0 银色 自排
icon.png[出售] Graco提篮汽座(有底座)2000元诚可议
icon.png[问题] 请问补牙材质掉了还能再补吗?(台中半年内
icon.png[问题] 44th 单曲 生写竟然都给重复的啊啊!
icon.png[心得] 华南红卡/icash 核卡
icon.png[问题] 拔牙矫正这样正常吗
icon.png[赠送] 老莫高业 初业 102年版
icon.png[情报] 三大行动支付 本季掀战火
icon.png[宝宝] 博客来Amos水蜡笔5/1特价五折
icon.pngRe: [心得] 新鲜人一些面试分享
icon.png[心得] 苍の海贼龙 地狱 麒麟25PT
icon.pngRe: [闲聊] (君の名は。雷慎入) 君名二创漫画翻译
icon.pngRe: [闲聊] OGN中场影片:失踪人口局 (英文字幕)
icon.png[问题] 台湾大哥大4G讯号差
icon.png[出售] [全国]全新千寻侘草LED灯, 水草

请输入看板名称,例如:BuyTogether站内搜寻

TOP