作者shinchenboy (欣承男孩)
看板Biotech
标题[求救] Non-coding RNA 查序列
时间Thu Feb 26 12:36:07 2015
就是
我最近刚从NGS的data中找到一群我有兴趣想观察的non-coding RNA
由於有些目前还没有人做过
所以在NCBI中搜寻不到序列
目前已知的资讯是那些ncRNA在Genome上的位置跟ID
想询问说有什麽网站或软体可以直接藉由上述两样资讯来寻找其cDNA的序列
以及gDNA的序列 如果能一起查到Exon及intron的资讯会更好喔
谢谢~
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1F：→ blence: 不是人的？ 是人的,有位置与ID应该有序列阿 02/26 12:54
2F：推 mesenchymal: UCSC or ensembl 02/26 13:26
3F：推 lelojack: 有在ensemble吗？ 可以从export data把设定区域的序列 02/26 16:36
4F：推 lelojack: 可以从export data把设定区域的序列存成fastA 02/26 16:36
5F：推 lingon: Just blat it or blast it first 02/27 03:39
6F：→ Ice9: 推 UCSC。比 Ensemble 直观多了。 03/20 09:10