作者orzman17 (God Bless Taiwan)
看板Biotech
标题[求救]CHIP 完之後 设计Primer 跑q-PCR
时间Fri Mar 20 00:01:39 2015
目前CHIP完纯化好DNA
也找好预测定的基因片段序列
可是设计primer 似乎要在 预测定的基因片段的promoter上
NCBI上在预测定序列 往前推了1000 base 找了很久
找不出来哪里是promoter 也不知道primer怎麽设计 囧
补充:预测定基因是Prox1 物种是Rat
请各位大大 协助 小弟在此谢过> <
※ 编辑: orzman17 (1.175.170.211), 03/20/2015 00:51:52
1F:→ blence: 对於这类的问题,如果是找"TF贴在哪段promoter"为实验目的 03/20 01:28
2F:→ blence: 究竟是reporter assay,还是用ChIP比较会优先考量? 03/20 01:29
3F:→ blence: 我是觉得reporter简单,可是会你不知道prom就应该是没做过? 03/20 01:32
4F:推 yuyu219: reporter是另外送进去的plasmid,方便,但不一定是真实 03/21 16:51
5F:→ yuyu219: 状况,ChIP会较贴近实际状况,会做ChIP通常应该是想看his 03/21 16:51
6F:→ yuyu219: tone modification 03/21 16:51
7F:→ blence: ChIP是想呈现直接bind证据,用TF直接IP就好,无关histone阿 03/21 19:31