作者patricksky (江伯)
看板Biotech
标题Re: [求救] PCR问题 以及plasmid浓度换算
时间Mon Feb 15 14:04:53 2016
※ 引述《Tsuyokunaru (小强)》之铭言:
: 大家好 因为我不是生科相关科系的 但是因为实验会牵涉到PCR
PCR的目的之一是复制双股DNA
PCR的主角有两个
一个是primer,是小片段的单股DNA,通常是一对,
每个通常15~25 base pair左右,用来认定你想复制的DNA区域,具有专一性
另一个是当作template(模板)的DNA
: 所以有些问题想请教......
: 我们一直都是用HBV当TEMPLATE (然後用自行设计的机构跑PCR)
: 只是最近想复制长片段 出现一些问题
为什麽想要复制长片段? 实验目的为何?
复制长片段的步骤是换了primer还是换了不同种DNA来源?
一般正常情况下,一组primer可以认定一种DNA区域,其复制出的长度大小固定
同一种DNA当作template,要变换复制的DNA长度,要重新设计primer。
: 跑胶後结果是亮在低於100bp的位置@@ (primer是大於400的)
: 不管是我们的机台还是传统机台 所以推测是我们DNA来源没有那麽长?
: 那是PRIMER DIMER吗? 还有其他可能性吗?
: 然後请教相关科系学姊 她说可以用plasmid当template
我觉得...这地方是不是把plasmid和HBV DNA搞混了...
一般高等生物都只有染色体DNA
而plasmid DNA有别於染色体DNA,可以自我复制,通常长度比较短,通常是环状
,多存在於细菌和酵母菌。
HBV的DNA是部分环状结构的DNA,不是染色体DNA,也不是palsmid DNA
所有DNA都可以是template,但是primer所认定的DNA区域只有当初设计出来的人知道
,并且一定要有留下primer的相关资料。
: 浓度是 0.1mg/ul
: 这边我有点不懂......
: 因为我们之前都是用例如 10^8 copies/ul 来标记浓度
: 那这样我要怎麽转换??
: 我查了一下 硷基对平均分子量660/mole
: 我看到有外国类似知识+的论坛有这个回答
: https://goo.gl/K5VpxV
: 可是 660 x 6 billion = 3.96 pico gram (pg) ???
: 不懂这是什麽意思?
: 所以还是想请问有人能浅显易懂的解说一下吗QQ
浓度转换google就有了,不过这不是重点
一般下的量是10-100 ng DNA or 1000-10000 copy DNA就PCR够用了
: 然後更换成这个TEMPLATE後
所以换了不同种DNA?
: 我们的机台还是跑在低於100bp... 传统就的确在正确位置了
所以这指的是换了不同PCR机台?
: 这样是anealing extension 时间不够?? 还是温度不够? 温度太高?
程式跑一样的情况下,不会换了机台就出问题,除非当初你设定的程式两台不一样...
: 因为短primer是ok的......
所以换了不同primer?
: 然後还有一个蠢问题
: 查了一下plasmid 这好像是细菌或酵母菌之类才有的
有别於染色体DNA,本身比较小,可以独自自我复制的DNA,通常存在於细菌和酵母菌
可以wiki查一下
https://en.wikipedia.org/wiki/Plasmid
: 可是HBV 不是病毒吗@@?
HBV是病毒,遗传物质是DNA,但不属於染色体DNA或plasmid DNA
: 因为不是学生物的 真的不是很懂这块 但是还是想要了解基本的
: 麻烦板友多多指教一下!!
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 203.65.71.253
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※ 编辑: patricksky (203.65.71.253), 02/15/2016 14:07:44