作者michaelhsien (MichaelHsien)
看板Biotech
标题[讨论] 推荐的RNA seq厂商
时间Mon Jul 11 10:07:26 2016
哈罗大家好
我的研究想要做RNA seq
询问了几家厂商，发现有不少人在做
像是 基龙米克斯、源资、图尔斯…等等（非广告）
但是不知道这几家厂商定序品质及事後分析服务是否完善
(我们不是很擅长生物资讯方面，所以希望事後分析要够好...)
请问板上的各位
是否有推荐的厂商
或是很雷的厂商…QQ
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 101.10.22.63
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1468202849.A.4CD.html
1F：推 jabari: 都很雷啊... 简单作法 叫每间都报 讨论你要怎麽作 07/11 13:18
2F：→ jabari: 如果你们lab本身找不到生资分析人员 我建议先找别的lab合 07/11 13:19
3F：→ jabari: 作 然後再请他们推荐要找哪间跑RNA seq 07/11 13:19
4F：推 silverberry: 泪推楼上! 07/11 16:05
5F：推 chong: 很多都是外包，收件後送到北京华大定序分析 07/11 17:23
其实我比较在意定序後的分析...
不知道jabari和silverberry有什麽辛酸血泪史吗...?
※ 编辑: michaelhsien (61.230.145.1), 07/11/2016 20:39:28
6F：推 michealking: 值拿回来 丢IPA 07/11 21:03
7F：推 lelojack: 厂商的好处是报告弄的漂漂亮亮的 很好理解，但没法跟你 07/11 21:14
8F：→ lelojack: 分析到最後， 学术合作可以跟你磨到後面，但报告的UI做 07/11 21:14
9F：→ lelojack: 不好 07/11 21:14
10F：推 abcam: 台湾的厂商都外送到大陆了～根本没有在台湾做啊 07/11 21:17
11F：→ abcam: 面对中国的产品与服务，我们就要面对他罗～(老板说的)datab 07/11 21:18
12F：→ abcam: ase 真的很庞大 07/11 21:18
13F：推 huuban: 看实验目的吧..厂商能出图表但不见得是你们想要的东西啊 07/11 22:07
14F：推 lingon: 不会做生资别花钱做RNASeq, 厂商的分析也不要太信 07/11 22:22
15F：推 jabari: 其实我想说RNAseq退流行了 现在有protein scan的... 07/11 22:27
16F：→ blence: 应该先问,你想得到怎样的data,以及只有RNAseq能解决问题? 07/11 23:00
17F：→ blence: 现在已经有许多OA data,厂商能给的也不脱离这些内容,如果 07/11 23:03
18F：→ blence: 你真的想送样,至少先知道後续会遇到的困难 07/11 23:06
19F：推 Alstonia: 先决定你要用的平台跟分析的方向或者有paper可以当范本 07/11 23:37
20F：→ Alstonia: 举例，再看看你预算的上限是多少，拿着这些去跟厂商讨 07/11 23:38
21F：→ Alstonia: 论。如果完全没经验的话建议跟楼上先进说的一样找人合作 07/11 23:38
22F：→ Alstonia: ，data产出後面的工作还很多，很难钱丢了就解决， 07/11 23:38
23F：推 Alstonia: 讲具体一点就是可以先想想你的论文或报告里希望能画出 07/11 23:48
24F：→ Alstonia: 怎样的图跟比较表，把这些需求同时跟厂商讨论这样会比 07/11 23:48
25F：→ Alstonia: 较清楚。 07/11 23:48
26F：推 Alstonia: 然後在台湾自己有机器自己跑的也还不少家，被对岸价格 07/11 23:52
27F：→ Alstonia: 压着打就是了。 07/11 23:52
28F：推 BGG: 要不要先做QPCR array看看mRNA表现量差异 07/11 23:58
29F：推 jabari: 先问清楚 这个计画一定得跑RNAseq吗? 还是他已经写死 你一 07/12 00:02
30F：→ jabari: 定得上... 或者是你们有候选基因了 只是跑一下到时候其中 07/12 00:03
31F：→ jabari: 报告好过关 因为这个坑很大啊...没有生资背景的拿到会被骗 07/12 00:03
32F：→ jabari: 很大 07/12 00:03
34F：→ lingon: 你跟老板从第28张开始看,看不懂的话做RNASeq很容易被骗 07/12 00:46
35F：→ lingon: 至於protein scan目前还只是炫而已...而且用途不同 07/12 00:48
36F：推 lingon: 虽然能够很直接量蛋白量,但能量到的蛋白还是有限,准度也.. 07/12 00:54
37F：推 jabari: 我认识一位受害者...欸 老板你来啦?? 07/12 03:31
38F：→ sunorange: 厂商都很雷，给的东西完全不能用 07/12 17:12
39F：→ sunorange: 我们後来都自行分析了，如果没有分析能力 07/12 17:13
40F：→ sunorange: 建议不要做，浪费钱而已 07/12 17:13