作者GG810424 (小G)
看板Biotech
标题[讨论] 请问版上有人用过Maxquant 分析SILAC吗？
时间Sat Sep 10 15:18:04 2016
我是利用UPLC-MS/MS 分析完的raw data ,有用SILAC heavy和 light label细胞，然後将
这个Raw data 拿去跑Maxquant ，操作是参考2016Maxquant summer school的影片学的（
YouTube)，但是分析完有许多protein的ratio 显示没有任何值或意义,後来发现是有全有
全无的现象，也就是说heavy 和light 其中一个signal 是得到0这个intensity ，如果不
希望算出来的值是没有意义，就必须要有最低值的设定，把0设定成100之类的，请问版上
有人有相关经验的吗？有用过Maxquant 的版友可站内信一起讨论，谢谢
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1F：推 tynse71864: 楼主是强者 快拜 ( 09/10 17:45
2F：推 grazzilybear: 可以利用persus分析,他有用分布补足ratio 09/22 10:44