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不常发文,排版差见谅 小弟最近在重复学姊的实验,用His-tag纯化蛋白 但是不管怎样都不纯,蛋白量也不多 实验条件是先以含有表达序列的pET28a 载体放入BL-21菌株中 接着涂盘筛选挑菌放入含有50ug/mL的LB broth中培养16小时 接着各加5mL的菌液到两瓶500mL的LB broth中培养至600nm OD=0.5~0.6 再加入IPTG使最终浓度为1mM 刺激表达蛋白4小时收菌 以10000g离心30分钟, 用50mL的buffer(50mM NaH2PO4,300mM NaCl,1mg/mL Lysozyme,1mM DTT,0.2mM PMSF,1% Triton pH=8) 将1L的菌 pellet冲起,冻入-80°C到隔天 冲水快速解冻後,冰上sonication 5分钟(on 30s off 30s,共10分钟) 接着与1mL NTA-beads於离心管中摇晃binding 1小时 收集beads之後填入管柱中 接着以50mL的10mM imidazole,50mM NaH2PO4,300mM NaCl的buffer冲洗 再以30mL的20mM imidazole冲洗 再以20mL的30mM imidazole冲洗 再以10mL的40mM imidazole冲洗 再以10mL的60mM imidazole冲洗 接着以4mL的250mM imidazole elute 收集清洗液40mM,60mM前面500uL 以及5管elute溶液 250mM 700uL跑胶 目标蛋白:红框里面,绿色及蓝色ladder中间那条,约30kD 结果60mM看起来清洗掉很多杂蛋白但非常不纯 附图:左到右40,60,250,250,250,250mM imidazole http://imgur.com/a/wlLg5 後来老师认为既然杂质蛋白太难洗掉,那降低pH值降低所有蛋白对NTA-beads的亲和力 反正含有His-tag的蛋白应该还是会牢牢的吸附在beads上 此外也不要摇晃binding 1小时,改用流过beads的方式binding就好,减少杂蛋白和beads作用的时间 因此新的条件将所有buffer改成pH=7.5 此外老师认为pH=7.5之下蛋白比较容易掉下来,所以清洗的gradient应该要改,盐类浓度也可以降低 所以imidazole洗到50mM就好,并且elute的NaCl浓度改成150mM 後面elute改成各用1mL的60,80,100,120,140,250mM imidazole 结果看来50mM清洗效果不佳,纯化的结果更加不纯 附图:左到右50,60,80,100,120,140,250mM imidazole http://imgur.com/a/tkv0g 小弟对於自己的情况有一些问题 首先老师表示: 正常来说His-tag纯化 30mM imidazole浓度就应该会把杂质洗掉,再提高浓度会把目标蛋白也洗掉,一定是我的蛋白表现量不好 再来就是因为管柱是用人工填充的,也是手动控制流速,老师认为这样再现性本来就不佳,要我操作更加谨慎 但表现量是学姊已经测试过的,难道是後来我再做,冻在-80的菌株已经不健康了? 另外我跟老师表示NTA-beads的protocol本来建议用pH=8,300mM NaCl进行实验,但老师认为protocol是死的,人是活的,不要太重视它 可是现在做了几次下来,都是原先的pH=8,300mM NaCl看起来效果最好 我又表示那如果我用2L的菌液去纯化,增加目标蛋白的总量去填满bead的空间使杂蛋白不易吸附,而且目标蛋白增加,也可以用稍高浓度的imidazole清洗,尽管目标蛋白有流失,最终也可以以量取胜 但老师认为如果我表现量不佳的话,就算增加表达的菌液培养量,目标蛋白占细菌总蛋白的比例还是不变,情况并不会有所改善 NTA-beads是Qiagen的 http://imgur.com/a/z7RfY his-tag纯化已经是个很常见的方式了吧,想请问有做过的大大们这方面的经验如何呢?? --



※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 140.128.123.73
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1484562216.A.3A3.html
1F:推 huangsw: 我的建议是, 你先跑一个有induction一个没有induction的 01/16 21:58
2F:→ huangsw: 先确定你的目标蛋白有正确且"大量的"被表现出来 01/16 21:59
3F:推 liuse: 楼上正解 01/17 10:21
谢谢大大的建议 因为是重复先前的实验,所以会一直参考前人的做法 我发现之前的学姊似乎没有比较induction前後的差异,但是因为实验室之前有纯化过其他蛋白,所以大家都不怀疑这样的induction条件,只担心inclusion body是否产生,但是学姊之前的测试结果是没有inclusion body,也能够纯化出蛋白 如果说induction条件真的不好,我有甚麽地方能改进呢,毕竟IPTG浓度已经用到1mM了,感觉只能增加表达时间? 然後因为没有inclusion body所以并不需要改变温度? 不过说到底老师还是一直认为是清洗的步骤不好QQ~但我已经没招了 ※ 编辑: s992003 (140.128.123.73), 01/17/2017 15:29:22
4F:→ s992003: 不知为啥会有一个段落重复两次 改不掉抱歉 01/17 15:30
5F:→ storm780121: his纯化完之後可以尝试再过其他column看看 01/21 17:17
6F:推 darit: 再过一个gel-filtration就好 不用在那边 02/16 01:00







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