作者feather2 (飞羽)
看板Biotech
标题[讨论] cloning PCR check
时间Mon Oct 23 15:35:57 2017
相信很多版上的大大使用过利用点菌PCR的方式来确认cloning
我会特别选用大於200bp 约500~1Kbp的长度
因为我觉得200bp的长度常常会不确定是不是正确的
另外胶图上也会确认长度对不对 尤其时浓度够不够
长度不对的机率蛮低的 但是浓度太低 其实是伪阳性的机率会有一点高
但是最近被问到利用qPCR来做 这样更快 也不用跑胶
只是这样的话 除了要改用很短的设计 也不能确定产物长度 浓度也较不好认定
不知道各位大大有没有相关的经验或是想法
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 140.112.121.119
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1508744159.A.573.html
1F:推 ABULA666: 你的实验目的应该是要挑到正确的DNA片段吧?用qPCR去筛 10/23 15:57
2F:→ ABULA666: 显得你工具用错地方,我个人觉得不如先用cloning PCR再 10/23 15:59
3F:→ ABULA666: 直接选有机会送定序,顶多送定序前先用限制酶确认,价钱 10/23 16:00
4F:→ ABULA666: 一定比qPCR试剂低,也不会用到额外的仪器 10/23 16:01
5F:→ feather2: 是cloning PCR 只是我们家有qPCR机器 就被要求用qPCR来 10/23 17:59
6F:→ feather2: 跑cloning PCR 比较快而且不跑胶 听起来好像也没错 10/23 18:00
7F:→ blence: 这叫colony PCR,前面就有个专家#1Ll7Pwcd 10/23 18:12
8F:→ blence: 真好奇是怎样的人给出这种建议 10/23 18:15
9F:推 ABULA666: 感谢楼上纠正,看文随手打时总觉得怪怪的XD 10/23 18:45
10F:→ xxtomnyxx: 你知道普通 PCR 和 qPCR 的价格差了多少吗 XD 10/23 21:50
11F:→ xxtomnyxx: 况且用 qPCR 来做 colony-PCR.....如果用 SIBR Green 10/23 21:52
12F:→ xxtomnyxx: 根本没办法分辨是 self-ligation 还是正确 insert 的 10/23 21:53
13F:→ xxtomnyxx: 产物吧?用 TaqMan 的话....我保证你实验室会破产 XD 10/23 21:53
14F:推 untilnow: 建议你查一下两者价差 10/23 22:30
15F:推 joseph103331: 定性的实验用到定量的技术本身就怪了,定量是要花 10/24 00:36
16F:→ joseph103331: 很多钱钱的 10/24 00:36
17F:推 aaaazzzz: 看到b大提的#1Ll7Pwcd,忍不住点进去看看,内容真是太棒 10/24 10:28
18F:→ aaaazzzz: 了!希望常常看到几位先进分享优质的文章 10/24 10:30
19F:→ feather2: 感谢大大的回应 我也觉得很怪 但上头这样问我 我也… 10/24 13:15