作者smallshin (where is fishi)
看板Biotech
标题[求救] 请问flux balance analysis原理
时间Sun Nov 19 17:44:14 2017
大家好，我在某篇文章看到flux balance analysis的实验方法
比较某个gene 没有knock out与knock out时，经过cecal ligation puncture
後48小时，先测量glycolysis和gluconeogenesis里面的metabolites(这些
metabolites用GC/MS和UPLC决定)，
测量出来的metabolites量再输入iMM1415这个老鼠的model
(这个model里面有老鼠所有基因和反应，以及将
某个基因或反应delete後所影响到的生理代谢作用例如glycolysis)
然後用flux balance analysis看ATP generation的方法，
评估glycolysis与gluconeogenesis的反应是增加还是减少
我想请问一下，
1.metabolites的浓度测量通常是用质谱仪量测吗？
2.为何要再将data整合进iMM1415这种老鼠的model
3.要如何利用ATP的产生多寡来判断反应的增加或是减少？
谢谢!
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