作者LUSRICH (ININ)
看板Biotech
标题[求救] 请问进行蔨种鉴定 NGS及MOLDI -TOF
时间Thu Jan 18 01:47:48 2018
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请问进行细菌 真菌 及古细菌菌种鉴定时，
该选择
NGS或MOLDI -TOF呢
送验之样本用这两种方式测到不同的结果
故有此困惑，先感谢感谢版大们之解惑了！！
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※ 编辑: LUSRICH (115.82.211.240), 01/18/2018 01:49:37
1F：推 jackhow: NGS 无误 01/18 08:43
2F：→ Ianthegood: 监定有需要打到ngs吗... 01/18 16:41
3F：推 rossy: NGS 01/18 18:14
4F：→ LUSRICH: 感谢板大们回覆 01/18 21:53
5F：→ LUSRICH: 我送验的样本是含多种未知菌的复合样本故先送NGS检测後 01/18 21:53
6F：→ LUSRICH: 验出其中有肠球蔨属之粪肠球菌，於是委托厂商以肠球蔨属 01/18 21:54
7F：→ LUSRICH: 的培养基分离，并再以malditof蛋白图谱去监种作二次确认 01/18 21:54
8F：→ LUSRICH: ，结果打出来的93个点都显示是另一种菌：耐久肠球蔨，接 01/18 21:54
9F：→ LUSRICH: 下来就卡关了 板大们建议以何种方式往下验证呢？感激不尽 01/18 21:54
10F：推 lingon: 未知的话NGS无误, NGS->ID->Validate(qPCR/clone)->seq 01/18 23:35
11F：推 lelojack: 临床客户,如果遇到生化跟Modi tof结果不一致,16s seq结 01/19 07:32
12F：→ lelojack: 果当标准 01/19 07:32
13F：→ lelojack: 建议你用Sanger seq定序培养出的clone 01/19 07:33
14F：→ LUSRICH: L大您说的是已纯化菌落的16s seq还是复杂样本直接打NGS的 01/19 12:49
15F：→ LUSRICH: 16s seq跟Molditof比时以16s seq为准呢 01/19 12:49
16F：→ LUSRICH: （我们送验—Molditof的样本是已纯化分离出来的菌落） 01/19 12:49
17F：→ LUSRICH: 感谢您 01/19 12:49
18F：推 lelojack: 这边指16s seq是PCR产物做Sanger 01/19 13:55
19F：推 lelojack: 简单来说 菌种检定 Sanger法比moditof 准 01/19 13:57
20F：推 lelojack: 以你的例子,建议用Sanger做菌种检定,而moditof是用来做 01/19 14:01
21F：→ lelojack: 初筛 01/19 14:01
22F：推 july81212: seq分离後的菌看是否跟TOF的一致 有些菌分离反而培养 01/20 02:37
23F：→ july81212: 不起来 01/20 02:37
24F：推 tingyang: 请问一下文中的moldi-tof还是maldi-tof? 01/21 00:44
25F：推 jming: Maldi-tof 01/21 18:52
26F：推 qozxcv: NGS做16S 05/18 12:14