Chemistry 板


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看了化学板很多年 终於从化学博毕业了 我的指导教授是极致放生类型 因此我几乎都是自学的 假如有错误的地方 大家也可以互相分享、指教一下 假如有同样七分靠自己三分天注定的研究生 希望可以带给你一点点的帮助 这篇主题在於"撰写国外期刊论文" 我是有机化学组的 因此以下都是以有机的期刊为例 而学位论文基本上可以视为期刊的扩充 如要写论文也可以用这思路来写 投稿期刊跟学位论文有个很重要的差异 在於期刊你写出来的最好都要有文献或实验支持你的论点 论文则没有一定要有实验结果支持 可以允许你有条理的将猜想写上去 ====================以下正文开始==================== (一) 选择期刊 首先在投稿前 强烈建议先选好目标再来写 从目标期刊挑几篇文章来看 可以是最多人读的、编辑推荐的等等 至於怎麽挑选期刊 原则上是从Journal Citation Reports (JCR)里挑 而期刊常会有多种子分类 以我来说会先看"Chemistry, Multidisciplinary" 因为包含最多 加上有些期刊收的主题比较广,点数也会高一点 进可攻退可守,原则可以先试高点数复合期刊 如果不行可以再往下选细部分类 接着必须评估自己的实验结果可以上到哪里 这需要经验、需要非常大量阅读期刊文章 才会知道做到什麽程度才有机会 一般可能是指导教授会建议可以投哪个 不过我是都自己挑就是了.. 更简单的挑选方式 就是从自己有看过的期刊开始筛 新手不用考虑你完全没看过的期刊 一来可能期刊做的不够出色 所以你在追踪文献时都没有碰到 二来选你熟悉、有在阅读的会更好上手 挑选出几个目标後开始排序 试着以旁观者角度看待自己研究 如果目标是Journal of the American Chemical Society 或是Angewandte Chemie International Edition 那你的研究够不够有新意? 实验结果能否强烈支持你的论点? 同时"时间"也是很重要的考量 越高的期刊要过reviewer那关就越不容易 对博士班而言,时间也是首要考量之一 你跟你的指导教授不一样,他有时间可以慢慢熬 但你是有毕业年限的 所以记得要把时间列入优先考量 除非你想走学术,有野心想发到最好的 如果自觉没办法发上太高点数的期刊 或是想快点凑足毕业门槛的话 就必须再往下看更细项 举两个药物期刊为例 分别是European Journal of Medicinal Chemistry 以及Bioorganic Chemistry 前者点数是4.833,在"Chemistry, Medicinal"分类中是5/61(Q1) 後者是3.926,在"Chemistry, Organic"分类中是13/57(Q1) 可以注意到他们分属不同子分类 这也表示以药物而言,前者对"药性探讨"的要求比较高 後者则是较重视"有机合成"的部分 回头看你的实验结果,会是哪一边更占优势 假如除了半最大抑制浓度(IC50)外 你还有做了对接模拟,细部作用机制探讨..等等 这些属於药性研究的部分,那就可以试试前者 但如果你生物实验部分结果不突出 但在合成部分有改良或是有利後续快速合成的途径 则可以试试後者 假如不确定的话还能怎麽看? 很多期刊不只一个子分类 除了用排名看强项/重视的点以外 也可以用排名来反推弱项/较不看重的部分 像Bioorganic Chemistry还有另一个 "Biochemistry & Molecular Biology"分类,是90/298(Q2) 这意味着这期刊对生物部分要求相对没那麽高 综合来看,也就是有机合成部分OK的,但生物弱的 就可以考虑这期刊 再举一个例子,Organic & Biomolecular Chemistry 他有三个分类 Organic Chemistry (Q1); Physical and Theoretical Chemistry (Q1); Biochemistry (Q2) 可以看出他在生化方面也是较弱的 尽管标题与物理没有直接关系 但他却有在物理及理论化学的分类 意味着他也接受有机合成+理论计算的实验 如果看了这期刊几篇文章 你会发现甚至有些文章完全没有做到生物实验 只要後续被认为有利於生化合成的改良 也会被这期刊接受 所以千万别只看期刊标题就判断适不适合投 要从子分类以及分类排名来考量 期刊也会在scope里讲述收件的门槛与拒收的类型 此外还有一些印象指标 对想走学术的人可能又更重要一点 就是"期刊的传统印象" 当两种期刊点数接近时 较老的前辈可能会认为某期刊要来的更好 就有机化学来说 像是Tetrahedron(1957至今) Tetrahedron Letters(1959至今) 尽管点数不到3 但对老一辈的来说可能印象分数会超越点数3~4的新期刊 最後价钱也是一个考量 有些期刊收费真的超级贵.. 在投之前先确认指导教授的意愿再决定 我是都投不收费的,问题会少很多 当然有些期刊跟你收钱,门槛可能就会低一点 至於是不是掠夺性的,网路上都有资料可以搜寻 (二) 注意格式 有的期刊会要使用template 有的则是free style 我自己是偏好free的 其实也没什麽,就是改格式实在累人 如果被拒绝等於你在调整格式做的努力都白费 真的要搞template也尽量以同个出版社的期刊为考量 这样在转换过程消耗你的精力会少一些 投期刊之前记得一定要看author guideline 里面会详细规范每一细项应有的条件 原则上同个出版社的差异不至於到太大 但改投时最好还是多看一下 一般投期刊可能要求提供以下档案 Cover letter (给editor的信,简述这篇内容) Highlights (精简列举此篇论文的特点) Graphical Abstract (图案版摘要) Manuscript (文稿正文) Supporting Information (实验数据等) X-ray结构的cif档或是CCDC code (有晶体数据时必备) CCDC code是用来验证你的结构是否正确并且加入资料库中 可以透过以下连结来申请 https://www.ccdc.cam.ac.uk/ 每个期刊差异会很大 所以记得投稿前做好checklist来确认是否有遗漏 内容怎麽写则可以参考同期刊发表的文章风格来打稿 然後谨记一点 introduction不要写太长 我有遇过一次写蛮长的,被reviewer说其实不需要这麽多XD 介绍是必要的,但尽量简洁精确 在上传投稿前务必确认每个作者的名字、单位没有错误 然後记得跟每个作者要他们的email才不会投一半卡关 以下讲些写文稿过程可能遇到的问题点 1. Graphical Abstract 蛮麻烦的一个工作,也许有软体能更好对应这个项目 我以最多人有的powerpoint来说明 要注意的点是"图案的长宽"跟"解析度" 期刊都有一定的规范 以Journal of the American Chemical Society为例 他是不得大於3.25 inches by 1.75 inches (approx. 8.25 cm by 4.45 cm). 我会先开一个powerpoint档案,先调整大小跟这相当 然後再开始画图案 有的期刊则是用相素(pixel)来规定大小 无脑的做法就是调整大小後存成图片右键看图片内容 会有显示他的相素长宽,再来慢慢细部调整 Graphical Abstract避免太多文字,尽量以图案表示 存成图片後直接打开来看要能清楚可见 再来则是存档格式,有的期刊只收tif档,有的则是不挑 但几乎都会要求图案解析度要是300 dpi或以上 然而一般windows预设达不到这程度 可以参考官方作法来更改 https://reurl.cc/j7k5zm 但如果是office 365,这可能就不一定有用 如果不行就想办法跟人借个2016以前的版本来试 然後对图案右键另存成图片 假如解析度不到,则改用另存新档的方式来存存看 存完了再右键确认详细资料是否有符合期刊的要求 2. 化学结构的PDF转换 第一个要注意的是期刊对结构的格式是否有要求 我是一直都使用ACS Document 1996这个设定 可以在File->Apply Document Settings from里看到 到目前是没有被说过结构要改 此外还要看你使用的chemdraw与word的版本对接行不行 强烈建议第一次从chemdraw直接复制贴上结构进word时 先存成pdf档看一下结构会不会歪掉、特殊符号是否正常显示 省得你全部弄完後还得回头一个一个修 我自己到後来都乾脆将结构全存成tif档案 这麽做一来能确保结构不会歪掉 二来解析度不会因为调整图片大小就糊掉 记得在另存成图档之前 将所有结构选取後按ctrl+G设成群组 可以预防偶发的位移问题 然後要看一下图档大小,正常应该不会超过1MB 假如超过的话,开新的chemdraw档案 先贴上结构再设成群组,理论上图档就会小很多 因为有时图档太大word会莫名其妙无法显示 3. 实验部分常见问题 首先常会被抓的是公司後面没有列出城市与国别 如Merck (Darmstadt, Germany),要记得打进去 假如是美国公司又有不一样的玩法 像是Alfa-Aesar (Ward Hill, MA, U.S.A.) 中间会要多加一个州名的缩写,网路上都可以查到 有机合成部分来说 如果数个化合物的合成步骤都差不多 可以写成一个general procedure,尽量缩减篇幅 接着是光谱问题,假如你是有机化学的 光谱问题一定要特别注意,99%的reviewer都会看 如1H NMR (500 MHz, CDCl3): δ 1.30 (t, J = 5 Hz, 2H) 注意H的1有没有上标,d-solvent写法正不正确 其中J一定要是大写斜体 再来是质谱Mass的写法,如 HR ESI-MS found 347.1067 [M+H]+ (calc. for C17H19N2O4S is 347.1066). 格式没有一定,但要有理论值跟计算值 记得注意两个值差距会不会太大 差太多reviewer可能会要你重测 4. 引用文献 这点也是个大坑,每个期刊都有自己的玩法 然後假如你有使用Endnote 请把他当成方便你整理跟移动文献的软体就好 最後你八成还是得自己手动修改细节 网路上都可以找到reference style 但最好再确认是不是真的符合期刊要求 如果期刊没特别讲,一般我都是使用ACS Style 因为我刚开始写的时候 真的被不同reviewer讲过为什麽缩写不是照ACS的规则 期刊缩写可以从CASSI资料库查 https://cassi.cas.org/search.jsp 以ACS style为例 格式是这样的 Vance, D. H.; Czarnik, A. W., 首先是作者,这边Endnote通常都蛮正确的 Real-Time Assay of Inorganic Pyrophosphatase Using a High-Affinity Chelation-Enhanced Fluorescence Chemosensor. 再来是题目,这也不太有问题 最後是最常出错的地方,期刊、卷号、页数 J. Am. Chem. Soc. 1994, 116 (20), 9397-9398. 用Endnote内建搜寻查到的常常缩写会有误,或者漏了部分页数 所以全部弄完後一定要再一个一个看一遍 题外话,如果Endnote搜寻不到该期刊文章 可以直接去该期刊文章网页 几乎都会有个Export->Export citation to RIS的选项 下载下来点两下就会导入Endnote里 当然假如有信心不会大幅移动篇幅的话 手打引用文献自然是最保险的 5. Supporting Information图片解析度问题 当你从PDF截图直接贴上word时 其实可以发现解析度都很差 解决办法是截图完贴上word後 直接右键另存成图片,再贴进word里 你会发现解析度会好不少 此外像光谱等这些带有文字数字的pdf档案 我都是放大到200%然後才开始撷取范围再贴进word 这样会让你图片中的文字更清晰 6. Acknowledgments与funding 前者是必备的,通常写感谢学校、科技部、贵仪等等 或是没有被列作者但有帮忙的人 经费来源通常也会写在这里 所以记得跟指导教授要计划编号,科技部可能会看这个 7. Response怎麽回? 我会将Reviewer的问题分段 在每个问题後面打上Response 开头最好都是先谢谢他的意见 接着尽最大努力详细回覆他的问题 一般没有直接reject的话机会就大增了 回覆可以用图片、用表格 假如他要你更动、改写段落 也将更改的段落换颜色打上去 可以省去他还要去看文稿搜寻的时间 当你修改完要投时 记得在cover letter里写上已照reviewer意见修改 将投稿的文章ID也附加上去 有的期刊是response可以挂在cover letter後面 有的则是独立出来的,上传时注意一下 6. 其他写文稿时的注意事项 要记得写文稿就像在叫卖东西 要尽可能的讲出优点 引用文献衬托这篇研究改良在哪 然後不一定要将所有data全放进文稿里 有些你觉得比较弱的,可以放去supporting info.里 只需在文字中讲到有做什麽实验来验证 有些reviewer不太会去看supporting info. 他如果忽略了就算是捡到了 目前是想到这些 如果之後有想到什麽再来补上 希望对还在奋斗的研究生有点帮助 谢谢大家 --



※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 118.233.29.77 (台湾)
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Chemistry/M.1585668966.A.339.html ※ 编辑: bittywind (118.233.29.77 台湾), 03/31/2020 23:39:56
1F:推 installbtien: 推 04/01 00:12
2F:推 lkkgotyy: 推 04/01 01:56
3F:推 asxc530530: 推 04/01 02:27
4F:推 wayne121212: 推推感谢大大经验分享 04/01 10:32
5F:推 adaplant: 好文 详细 请板主m文 04/01 12:38
6F:推 Karrigan777: 详细推 04/01 13:02
7F:推 aromaQ626: 推 04/01 17:19
8F:→ RendomFly: 没有想战的意思, 但是如果念到博班, 还不能判断自己的 04/01 20:20
9F:→ RendomFly: 工作大概是哪个等级的文章, 只依照 impact factor 去看 04/01 20:21
10F:→ RendomFly: 我会觉得有点白做了... 04/01 20:22
11F:→ bittywind: 楼上也没说错,所以这是新手向的意见,我是认为真的得 04/01 20:44
12F:→ bittywind: 读够多文献才会比较有直觉,不过每个人习惯不同不勉强 04/01 20:45
13F:推 zzxxzz: 细节推 04/02 19:58
14F:推 nmjkluiop: 文章细节讲蛮好看到那些细节又让我回想起地狱时光- - 04/03 02:12
15F:推 Adwin: 给助理教授投稿的参考做法,还不赖,等有名气之後,基本上 04/04 21:49
16F:→ Adwin: 就是照研发的卖点和创新去投期刊,分享小经验,有一次投JA 04/04 21:49
17F:→ Adwin: CS被reject後转投angewandte chemie,反而上了。 04/04 21:49
18F:推 Roentgenium: 推 04/05 01:27
19F:推 Falajack: 应该要m起来 04/05 14:15
20F:推 ming7392: 推好文值得精华 04/05 15:50
21F:推 YBlueMoon: 好文推 04/14 13:50
22F:→ woosa5566: 我老板也抱怨过JACS越来越picky XDD 04/17 23:16
23F:推 blackpanther: 正因为挑惕所以JACS品质相对稳定啊。 04/21 07:03
24F:→ blackpanther: 过去十年ACIE的IF值大致在11-13间浮动,但JACS则是 04/21 07:09
25F:→ blackpanther: 从十年前的9一路稳定爬到现在快15。 04/21 07:09
26F:推 highshorter: 近期投JOC有被要求CIF档要丢checkcif确认档案是否完 05/23 00:55
27F:→ highshorter: 整 05/23 00:55
28F:推 saa18972: 有推两年毕业 06/23 01:42







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