作者microball (无华之果)
看板Policy
标题Re: [新闻] 生物资讯学领域简介
时间Fri May 27 10:48:06 2011
生物资讯现在还没有正式跟医药结合,所以产值还不高。
以可预见的展望来看,我认为十年内可能成为商机的有
(1) 个人化基因定序 (2) 组织特异的基因表现
人类基因组大约有 3 Giga base pair 个 nucleotide,
加上所有染色体都有两套(除了男性的X和Y),所以总共约 6 Giga base pair
现在学界有几套人类基因组的标准序列,但每个人的基因序列都有些微差距
但序列上的差距,有些尽管很小,也能在遗传疾病上造成显着影响
例如带有特定序列会较容易得帕金森氏症等等。
对於不同序列的个体,将来在医疗用药上可能有不同方式
像是现在癌症治疗很热门的标靶药物,有些就必须先了解个体的基因型再选择疗法。
现在的疾病筛检只针对部份DNA定序,因为整体定序还太昂贵
将来整体定序一定有市场 (现在美国已经有厂商推出大约 1000 美元的全基因组定序)
近年定序的成本不断降低,源自於奈米技术和平行定序的进步,
另外也包跨更好的演算法和硬体来分析序列。
这些都是很硬的工夫,尤其是要做大量平行定序,现在都是奈米元件在做
可以想像专利竞争非常激烈,以国内厂商来说,还看不出有人愿意自己研发这块
因为做这边等於同时要奈米技术 + 生化科技,还不包括後续资料分析
技术层面非常吃重,而且需要跨领域团队。
投资下去烧钱烧几年,可能勉强跟上同行进度而已。
*
基因组的不同基因会被转译成不同 mRNA,细胞内各种 mRNA 的浓度是很重要的指标
现在主要的测量方法是用 micrarray,也有更新一代用 RNA sequencing 来测量。
从 mRNA浓度可以推得细胞的状态,
例如可以分辨健康的细胞/癌细胞/是否发炎或被病毒感染等等
但是现在不管是 microarray 和 RNA sequencing 都太过昂贵,
还没办法帮每个病患做这麽多的测量 (体内的 mRNA 有上万种,全部测量并不容易)
随着成本下降,这也是将来的商机之一,
因为了解细胞状态可以帮助诊断跟治疗 (现在主要是用组织染色来人工判定细胞状态)
microarray 的技术门槛在於合成不同 oligo-nucleotide 作为不同种mRNA的探针
并将其有序的连接在基质上面。目前制造方式有两大类:
(1) 是直接在基质上合成 oligo-nucleotide,合成过程类似电路,需要光罩等等
(2) 是合成了 oligo-nucleotide 後,将其喷印到基质上面
这两者技术门槛都很高,(1) 是affymetrix专利,(2) 的喷印过程需要精密机械控制
我有听说大陆在过去十年对於 (2) 的投入已经成熟,现在有量产专门的喷印机器
有些市面上欧美的 microarray 公司,其喷印机器是 made in China 的
RNA sequencing 和 DNA sequencing 技术类似,主要是奈米科技 + 生化技术
目前市面上有数家厂商有量展 parallele sequencing 机器,
如果国内能自己突破专利封锁,应该有机会开出极有竞争力的价格。
*
综合来说,在我谈的这两个例子,需要的机械/材料/生化技术门槛都相当高
我印象中新一代的定序技术都是欧美厂商在研发,东亚各国目前缺席。
国内连自行组装传统定序仪都没听说过,
microarray 有数家国内厂,但产品似乎比较局限,
国内实验室常常还是购买国外的 microarray。
关於 bioinfo 的这两项生物科技,以目前台湾本土技术来说,
要跟国际厂推出相似产品竞争,至少需要数年以上的准备阶段,
即使成功可能也必须走低价路线,回收成本堪虑,属於高风险的投资。
这也许是国内在落後欧美十年後,仍然是以中低阶/国内客制化的生技产品,
而无法进入主流国际市场的原因。
--
这是你吗 你要这样的过吗
这是你吗 你错过了自己吧
就这样吗 把你自己信仰 来换别人所谓的天堂
这是你吗 是谁给了你框框
这是你吗 把你自己都遗忘
你的心 毕竟是你自己的地方
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 98.221.193.148
※ 编辑: microball 来自: 98.221.193.148 (05/27 10:49)
1F:→ reinherd:这已经不算是BIOINFOR的范畴了,目前Bioinfor的企业集中在 05/28 00:13
2F:→ reinherd:印度专门作computational biology的程式设计 05/28 00:13
3F:→ reinherd:或是在药厂利用程式去跑small molecule筛选(减少bench 05/28 00:15
4F:→ reinherd:work的试验) 重点是台湾的生物人才养成以bench为主 05/28 00:16
5F:→ reinherd:这没有说对错 只是强调的方向(我就是玩很传统bench的生物 05/28 00:17
6F:→ reinherd:但是我在美国遇到的印度同学 清一色大学都是搞bioinfor 05/28 00:17
7F:→ reinherd:bioinformatic重点在於程式设计,你提的这些是genomic 05/28 00:18
8F:→ reinherd:根本就是不一样的东西 05/28 00:18
9F:→ reinherd:microarray可靠不可靠见仁见智,我是不太相信mRNA profile 05/28 00:19
10F:→ microball:对,这是genomics没错,看你怎麽定义bioinfo相关产业 05/28 07:20
11F:→ microball:总要有raw data 才能做 bioinfo 05/28 07:21
12F:→ reinherd:你可以设计程式卖钱阿,有时候不要想去挑战太艰难的东西 05/29 22:23
13F:→ reinherd:基本的市场先顾好才能一步一步往下走,否则永远画大饼 05/29 22:24