作者b10009047 (Nicklee)
看板R_Language
标题[问题] 关於平行运算
时间Fri Jan 29 18:05:43 2016
[问题叙述]:
大家好，最近接触到'snow'这个用於平行运算的package後觉得十分有趣，刚好目前在做
的事情十分需要加快计算速度，因此尝试使用parRapply, parSapply这些function
突然发现，若是我在parRapply当中在包一个apply，或是parRapply function都会产生
问题，例如 :
library(snow)
library(Rmpi)
data <- matrix(1:6, ncol = 2)
target <- 11:16
cl <- makeCluster(2, type = 'MPI')
parRapply(cl = cl, data, function(x) {
x <- t(as.matrix(x))
parRapply(cl = cl, x, function(x){
target[x]
})
})
stopCluster(cl)
会回报错误讯息：
Error in checkForRemoteErrors(val) :
2 nodes produced errors; first error: 找不到物件 'cl'
唯一能想像的到的可能为，cl可能是在某个cpu下被定义的，但其他cpu并不知道cl的定义
因此产生以下错误讯息，此外也想不到其他可能的原因，想请教是否有人有碰过相同的
问题呢？
谢谢各位！
[软体熟悉度]:
使用者(对R的基本使用还算熟悉)
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1F：→ celestialgod: 你现在function里面已经是在各个计算节点了 01/29 18:14
2F：→ celestialgod: 你计算节点中并没有命名cl给他，他当然抓不到 01/29 18:14
3F：→ celestialgod: 改一下标题，方便後面的人搜寻 01/29 18:18
4F：→ celestialgod: function里面请直接用正常的apply就好 01/29 18:19