R_Language 板


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※ 引述《anakinyen (我在台北 天气晴)》之铭言: : [问题类型]: : : 程式谘询(我想用R 做某件事情,但是我不知道要怎麽用R 写出来) : : [软体熟悉度]: : 新手,只会套用package : [问题叙述]: : 我有一批动物研究的资料 : 资料大致长这个样子,共有12只个体一万多笔 : 个体A 2012/10/11 20:00 实验资料OOXX : 个体A 2012/10/11 23:00 实验资料OOXX : 个体A 2012/10/12 03:00 实验资料OOXX : 个体B 2012/12/11 05:00 实验资料OOXX : 个体B 2012/12/11 11:05 实验资料OOXX : 个体B 2012/12/11 13:00 实验资料OOXX : 个体B 2012/12/11 18:00 实验资料OOXX : 个体B 2012/12/11 20:00 实验资料OOXX : 由於时间间隔过短的话,资料之间可能有相关性 : 因此我现在想要设定6小时的阀值,间隔超过6小时的资料才会保留 : 以上面资料为例 : A个体保留第一、第三笔资料 : B个体保留第一、第二、第四笔资料 : 我的程度是新手,偶尔会拿一些package来套用 : 请教是否有相关套件或现成code可以用在这个案例 : 非常感谢~~ 我用while + data.table做,若用data.frame会复制很多次,效率会不彰 library(data.table) # 产生资料 numObs <- 50 numInd <- 5 DT <- data.table(ind = paste0("A", sample(numInd, numObs, TRUE)), time = strptime("2012/12/11", "%Y/%m/%d") + sample(86400, numObs, TRUE), obs = rnorm(numObs)) # 排序 setorder(DT, ind, time, obs) # 移除掉时间差小於六小时的 k <- 1 while ( TRUE ) { # 计算时间差,以小时表示 DT[ , diffTime := difftime(time, time[min(k, .N)], units="hours"), by = ind] # 留下自己那一组 set(DT, which(DT$diffTime == 0), which(names(DT) == "diffTime"), 1e6) # 留下时间差超过六小时的 DT <- DT[abs(diffTime) > 6, ] # 下一组 k <- k + 1 # 如果k大於全部组的最大观测值数目就跳离回圈 if (k > max(DT[ , .(numObsGroup = .N), by = ind]$numObsGroup)) break } # 移除diffTime这个变数 DT[ , diffTime := NULL] 五万笔观测值,一千个个体,耗时0.23秒 (平均一个个体50个观测值) 五十万笔观测值,一千个个体,耗时0.39秒 (平均一个个体500个观测值) 我觉得这个速度应该可以接受 不过我的区间只有24小时,所以可能都很快就筛选完了 有人可以试试看更长时间的表现 有问题或任何人有更好解法,欢迎提供,感谢 Note: 间隔一百天,五十万笔观测值,一千个个体,耗时18.33秒 --



※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 36.234.179.110
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/R_Language/M.1486388879.A.9C1.html
1F:推 cywhale: 推~看过有用roll join解类似问题 https://goo.gl/Sv0cU2 02/06 23:53
c大这个好强@@,我喜欢XD
2F:→ anakinyen: 非常感谢~~ 我来试试看 02/07 11:24
有问题可以再推文问 ※ 编辑: celestialgod (111.246.24.51), 02/08/2017 19:44:09
3F:推 cywhale: 後来稍微尝试roll join 但不适合原po这个题目 因为他是 02/09 15:17
4F:→ cywhale: 循序要第一笔 然後大於6hr该笔,再循序下找,没法一次做 02/09 15:18







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