作者w32123 (Ru)
看板R_Language
标题[问题] 分群和找位置相关问题
时间Wed Oct 31 18:11:22 2018
[问题类型]:
程式谘询(我想用R 做某件事情，但是我不知道要怎麽用R 写出来)
[软体熟悉度]:
入门(写过其他程式，只是对语法不熟悉)
[问题叙述]:
各位大神大家好~
http://i.imgur.com/tbduH5L.jpg
这个图中的每一小坨是植物的位置
是先对每个点的光谱值做kmeans分四群後找出来的
四个顶点是边界范围
我想找出散布在图中每一坨的中心点当作植物中心点
也想知道中心点的位置和个数
Hclust我只放入了x,y座标让他们分群可是感觉分不太出来QQ结果如图
http://i.imgur.com/mrC8b6c.jpg
想请问有除了分群以外的方法吗?
另外想让R自动决定分群数 有尝试过elbow method
但是都会出现Error: cannot allocate vector of size 91.4 Gb
不知道自动决定分群数有没有比较推荐的方法呢
先谢过各位大神了~
现有每个点的资料格式如图
最左边是序号 band1~4是光谱值 x,y是x,y座标
http://i.imgur.com/UUPYeCU.jpg
[程式范例]:
plant.cluster <- hclust(dist(remain.plant.add[,1:2]),method = "ward.D2")
png("hclust.png",res = 200,width = 2259,height = 1549)
plot(plant.cluster)
dev.off()
#elbow method
elbow.k <- function(mydata){
dist.obj <- dist(mydata)
hclust.obj <- hclust(dist.obj)
css.obj <- css.hclust(dist.obj,hclust.obj)
elbow.obj <- elbow.batch(css.obj)
k <- elbow.obj$k
return(k)
}
elbow.k(NDVI)
#Error: cannot allocate vector of size 91.4 Gb
[环境叙述]:
R version 3.5.0 (2018-04-23)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[2] LC_CTYPE=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[3] LC_MONETARY=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[4] LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods
[7] base
other attached packages:
[1] ggplot2_2.2.1 NbClust_3.0 rgdal_1.3-3 sp_1.3-1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Rcpp_0.12.18 lattice_0.20-35 crayon_1.3.4
[4] grid_3.5.0 plyr_1.8.4 gtable_0.2.0
[7] scales_1.0.0 pillar_1.3.0 rlang_0.2.2
[10] lazyeval_0.2.1 rstudioapi_0.7 labeling_0.3
[13] tools_3.5.0 munsell_0.5.0 compiler_3.5.0
[16] colorspace_1.3-2 tibble_1.4.2
[关键字]:
分群、中心点、位置
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 117.19.1.14
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/R_Language/M.1540980684.A.F97.html
1F：→ Wush978: 如果用别的分群演算法呢? 例如 dbscan or supc 10/31 19:04
2F：推 andrew43: 看起来很均匀，这样硬要分群没什麽意思。 10/31 20:21
4F：推 eric500g: 就图来看，是个平行四边形，每坨也差不多等距，何不直接 10/31 21:59
先感谢楼上几位大神的回答，会再尝试看看dbscan和supc。 nbclust之前有试过（忘记写在内文抱歉）但也是一样的error: 91.4gb QQ 也有想过直接算出每坨的中心点，但是从我的资料中看不出来哪些点是属於哪一坨的QQ 所以才会想说分群不知道能不能看出来哪些点是同一坨这样~若大神们有各种想法都欢迎提出，谢谢您们宝贵的建议！
5F：→ eric500g: 算出大概的中心点？不知道理解有没有错 10/31 21:59
※ 编辑: w32123 (117.19.1.14), 10/31/2018 22:26:21
6F：→ andrew43: 光谱资料和座标资料有关吗？你实际想分析什麽？ 11/01 10:13
7F：推 Bourdieu1984: 试试fpc套件的pam函数 11/09 07:29